sqlite和python。。。快速而狂暴

Question

我用python实现了一个从protein fasta文件构建数据库的程序。fasta文件是包含一些大分子序列的文本文件。您可以阅读有关here的更多信息。 我的程序从每个蛋白质中产生一系列肽，它们是蛋白质的片段。为了实现我的目标，程序在SQLite中构建和查询数据库。在

你知道在python中是否有很多技巧可以更快地填充或查询sqlite数据库？ 如果我使用像SQLAlchemy这样的层或orm，我能提高性能吗？在

Answer 1

你不会提高性能，ORM层会增加一点开销，但是你可能可以更容易地进行实验。考虑到数据的大小，您可能可以create the database in memory这会更快。或者您可能需要查看不同类型的数据库，例如redis。在