在linux上使用gcc4.7.2安装带有MKL10.3的numpy1.7.1

Question

几天来，我一直试图在linux-2.6.18-308.24.1.el5系统上使用gcc-4.7.2在linux-2.6.18-308.24.1.el5系统上安装numpy-1.7.1和{}。不久前，我用同一个编译器用MKL成功地编译了R-3.0.1。在

我修改了numpy-1.7.1中的site.cfg文件，如下所示：

[mkl]
library_dirs = /sb/software/libraries/MKL/10.3/lib/intel64
include_dirs = /sb/software/libraries/MKL/10.3/include
mkl_libs = mkl_rt
lapack_libs =

当我调用python setup.py install时，它找到BLAS和LAPACK的MKL库。在此之前，没有投诉或警告。一旦我试图用numpy做一些事情，它就会崩溃。在

^{pr2}$

这似乎是一个已知的问题（link to source），其中libiomp5不是由libmkl_rt加载的。当我将libiomp5的路径添加到site.cfg中的library_dirs变量时，numpy无法检测所有库。在

我甚至尝试过下面的方法来强制gcc使用它自己的openMP库/头，但是没有用。在

CFLAGS='-fopenmp -lgomp' python setup.py install

在这件事上，如能得到任何帮助或建议，我将不胜感激。请不要犹豫，让我知道我忽略了这个线程中的关键信息。在

编辑：我在x86_64平台上运行。在

Answer 1

您需要将路径添加到libomp5:composer_xe_install_path/compiler/lib/intel64 去你的图书馆路。对我来说，路径是：/opt/apps/intel/16.1/compilers_and_libraries_2016.1.150/linux/compiler/lib/intel64