我想用matplotlib创建一个动画来监视聚类算法的收敛性。它应该在第一次调用时绘制我的数据的散点图,并在每次更新绘图时绘制错误省略号。我尝试使用canvas_copy_from_bbox()
和restore_region()
来保存散点图,然后在更新绘图时绘制一组新的省略号。
然而,代码只是在旧的椭圆上绘制新的椭圆,而没有首先清除之前的椭圆。
我怀疑,这种方法在Ellipse()
和add_path()
命令中不起作用,但我不知道如何解决这个问题。在
代码如下:
import wx
import math
from math import pi
from matplotlib.patches import Ellipse
from matplotlib.figure import Figure
from matplotlib.backends.backend_wxagg import \
FigureCanvasWxAgg as FigureCanvas
TIMER_ID = wx.NewId()
class _MonitorPlot(wx.Frame):
def __init__(self, data, scale=1):
self.scale = scale
wx.Frame.__init__(self, None, wx.ID_ANY,
title="FlowVB Progress Monitor", size=(800, 600))
self.fig = Figure((8, 6), 100)
self.canvas = FigureCanvas(self, wx.ID_ANY, self.fig)
self.ax = self.fig.add_subplot(111)
x_lims = [data[:, 0].min(), data[:, 0].max()]
y_lims = [data[:, 1].min(), data[:, 1].max()]
self.ax.set_xlim(x_lims)
self.ax.set_ylim(y_lims)
self.ax.set_autoscale_on(False)
self.l_data = self.ax.plot(data[:, 0], data[:, 1], color='blue',
linestyle='', marker='o')
self.canvas.draw()
self.bg = self.canvas.copy_from_bbox(self.ax.bbox)
self.Bind(wx.EVT_IDLE, self._onIdle)
def update_plot(self, pos, cov):
self.canvas.restore_region(self.bg)
for k in range(pos.shape[0]):
l_center, = self.ax.plot(pos[k, 0], pos[k, 1],
color='red', marker='+')
U, s, Vh = np.linalg.svd(cov[k, :, :])
orient = math.atan2(U[1, 0], U[0, 0]) * 180 / pi
ellipsePlot = Ellipse(xy=pos[k, :], width=2.0 * math.sqrt(s[0]),
height=2.0 * math.sqrt(s[1]),
angle=orient, facecolor='none',
edgecolor='red')
self.ax.add_patch(ellipsePlot)
self.canvas.draw()
self.canvas.blit(self.ax.bbox)
现在的情况是,每次都在绘图中添加新的补丁,然后在调用
self.canvas.draw()
时绘制所有这些补丁。在最快的修复方法是在添加每个补丁后调用
self.canvas.draw_artist(ellipsePlot)
,并删除对self.canvas.draw()
的调用作为一个简单的独立示例:
但是,随着时间的推移,这可能会导致内存消耗问题,因为axis对象将跟踪添加到其中的所有艺术家。如果你的坐标轴不能长时间挂起,这可能可以忽略不计,但你至少应该意识到它会导致内存泄漏。解决这个问题的一种方法是在绘制每个椭圆后调用
ax.remove(ellipsePlot)
来删除轴上的省略号艺术家。然而,这仍然有点低效,因为您不断地创建和销毁椭圆艺术家,而您可以只更新他们。(创建和销毁它们没有太多开销,不过,这主要是一个风格问题…)如果椭圆的数量随着时间的推移保持不变,那么只需更新每个椭圆艺术家对象的属性,而不是创建和添加新的椭圆艺术家对象会更好、更容易。这将避免删除轴上的“旧”省略号,因为只有您需要的数字将永远存在。在
作为一个简单、独立的例子:
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