在字符串模板中编写for loop元素时,我有一个小问题,如下所示:当我试图用三个循环元素制作一个字符串模板时,我只能打印最后一个元素,而不能打印前两个元素。我认为这个错误是由于写文件时的一些问题造成的,但是我不知道我的代码到底有什么问题。所以如果有人能帮我这个忙。在
My SCRIPT:
from string import Template
import os
AMONIOACIDS = {'A': 'ALA', 'C': 'CYS', 'E': 'GLU', 'D': 'ASP', 'G': 'GLY',
'F': 'PHE', 'I': 'ILE', 'H': 'HIS', 'K': 'LYS', 'M': 'MET',
'L': 'LEU', 'N': 'ASN', 'Q': 'GLN', 'P': 'PRO', 'S': 'SER',
'R': 'ARG', 'T': 'THR', 'W': 'TRP', 'V': 'VAL', 'Y': 'TYR'}
rPrS={'C': '102', 'A': '104','H': '12'}
a=[]
b=[]
count=1
for single, third in AMONIOACIDS.iteritems():
for rS,rP in rPrS.iteritems():
if rS == single:
a.append(["s"+str(count)+"=selection(mdl1.chains["+chain+"].residues["+rP+"])"])
b.append(["s"+str(count)+".mutate(residue_type='"+third+"')"])
str='''Loop elements\n'''
for i,j in zip (a,b):
i=''.join(i)
j=''.join(j)
str+='''$i\n'''
str+='''$j\n'''
str=Template(str)
str.substitute(i=i, j=j)
file = open(os.getcwd() + '/' + 'model.py', 'w')
file.write(str.substitute(i=i,j=j))
file.close()
预期输出:
^{pr2}$我得到的是:
Loop elements
s3=selection(mdl1.chains[A].residues[12])
s3.mutate(residue_type='HIS')
s3=selection(mdl1.chains[A].residues[12])
s3.mutate(residue_type='HIS')
s3=selection(mdl1.chains[A].residues[12])
s3.mutate(residue_type='HIS')
您的模板将从
i
的最后一个值和for
循环中的j
获取其替换值。您需要保存上一次迭代的值。怎样?您可以在每次迭代中使用字典和计数来存储和区分值。在你可以substitute values in a template using a dictionary。我在每次迭代中都使用count变量来创建相应的字典键:},}、
i_0
,i_1
,i_2
,和{j_1
,j_2
。这些相同的名称在模板$i_0
、$i_1
、$i_2
、和{$j_1
、$j_2
中用作标识符。在safe_substitute
安全地将每个键上的值替换到模板中,例如将键i_0
替换为模板标识符$i_0
。在字典在每次迭代时存储
i
和j
的所有值,模板中的替换将在字典中的每个键处取适当的值。此部分应修复:我已经将名称
str
替换为s
,以避免隐藏str
。在修复之前,不需要在前面的代码块中进行其他更改。在相关问题 更多 >
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