有没有办法在一个目录中运行所有Jupyter笔记本？

Question

导言

我在一个目录中有很多Jupyter笔记本，我想运行它们来查看它们的输出

我到底做了什么

我必须打开每一个，单击“重新启动内核并重新运行整个笔记本？”，等待几分钟，然后开始下一个

我想做什么

找到一种方法，只需“按下一个按钮”（它可以是脚本、命令或所有内容），出去散散步，然后回来阅读输出内容

提前谢谢

Answer 1

您可以将要在.py文件中运行的每个笔记本转换，然后创建一个笔记本，将它们作为模块导入。大概是这样的：

脚本1.py：

print('This is the first script.')

脚本2.py：

print('This is the second script.')

脚本3.py：

print('...and this is the last one!')

现在，您可以在单个脚本中导入它们（您可以在Jupyter中创建）：

import script1
import script2
import script3
# This is the first script.
# This is the second script.
# ...and this is the last one!

Answer 2

您可以通过nbconvert或papermill实现这一点。 另见this answer

这是papermill中的一个示例：

使用Anaconda安装：

conda install -c conda-forge papermill

创建一个运行特定目录中所有笔记本的新笔记本：

import papermill as pm
from pathlib import Path

for nb in Path('./run_all').glob('*.ipynb'):
    pm.execute_notebook(
        input_path=nb,
        output_path=nb  # Path to save executed notebook
    )