np.savetxt即使在文件仍处于打开状态时也不会追加

Question

编辑！！！ 最后，我能够用我想要的while循环来写这篇文章，并在附加时保存到正确的输出文件夹中

解决方案：

tempfilename=keyname+'_trimmed.fastq'
TempSavelocation="./fastqs/"+tempfilename
f=open(TempSavelocation,'ab')
icounter=0
while icounter < len(tempid): 
    with open(TempSavelocation,'ab') as f:
    # Creating the type of a structure                  
    structuredArr=np.array([tempid[icounter],tempseq[icounter],"+", tempqc[icounter]])
    np.savetxt(f, structuredArr, fmt=['%s'])  
    icounter=icounter+1 
f.close()

这给了我正确的输出，我也尝试了for循环，但有一段时间我对我的特定问题最有用

问题:

问题是，当我运行npsavetext时，它无法正常工作，我最初将其作为一个while循环（在我看来，这是最理想的方法，循环遍历具有匹配列表的列表并将它们附加到单个文件中）

下面是我的代码：

atable=['a','b','b','a','b','b']
f=open(tempfilename,'ab')
f.write(b"\n")
with open(tempfilename,'ab') as f:
    for s in atable: 
        structuredArr=np.array([s,"+"])    
        np.savetxt("./fastqs/"+tempfilename, structuredArr, delimiter=' ', fmt=['%s'])  
f.close()

预期结果如下：

a
+
b
+
b
+
a
+
b
+
b

实际结果是

+
b

理想情况下，我想做的是 下:

icounter=0
    f=open(tempfilename,'ab'
    while icounter < len(tempid): 
        with open(tempfilename,'ab') as f:
            # Creating the type of a structure
          structuredArr=np.array([tempid[icounter],tempseq[icounter],"+",tempqc[icounter]])
            np.savetxt("./fastqs/"+tempfilename, structuredArr, delimiter=' ', fmt=['%s'])  
            f.write("\n")
        icounter=icounter+1 
    f.close()

我认为后者可能没有附加，因为我的while循环

任何帮助都会很好

Answer 1

使用with open时，使用缩进块进行保存

In [329]: atable=['a','b','b','a','b','b'] 
     ...: with open('abtest.csv','ab') as f: 
     ...:     for s in atable:  
     ...:         structuredArr=np.array([s,"+"])     
     ...:         np.savetxt(f, structuredArr, delimiter=' ', fmt=['%s'])   
     ...:                                                                                
In [330]: cat abtest.csv                                                                 
a
+
b
+
b
+
a
+
b
+
b
+