`import pandas`in Rmarkdown:在控制台中工作，但不针织

Question

我试图在RStudio中的Rmarkdown文件中编写Python代码。一般来说，它很好用。我可以编写代码块并将它们完美地组合在一起。我还可以导入和使用包：任何使用numpy或math的东西都可以很好地运行和编织

尽管能够运行和组织使用其他包的代码块，但当文件包含使用pandas的代码块时，我似乎无法组织该文件。我可以运行这些块并获得预期的输出。最简单的例子是：

import pandas as pd

它返回（预期）输出：

Python 3.9.4 (/usr/local/bin/python3)
Reticulate 1.20.9000 REPL -- A Python interpreter in R.

（我还可以使用pandas函数运行代码块。）

问题是，当我编织时，我得到了错误：

Error in py_call_impl(callable, dots$args, dots$keywords) : ModuleNotFoundError: No module named 'pandas' Detailed traceback: File "<string>", line 1, in <module> File "/Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.0/Resources/library/reticulate/python/rpytools/loader.py", line 44, in _import_hook level=level Calls: <Anonymous> ... py_capture_output -> force -> <Anonymous> -> py_call_impl Execution halted

我不明白为什么我能够运行这些代码块，但不能编织它们

谢谢你的帮助

Answer 1

对于一个简单的示例，您的Rmarkdown文件是否与此类似

 -
title: "Untitled"
author: "User"
date: "5/6/2021"
output: html_document
 -

    
```{r setup, include=FALSE}
library(reticulate)
```
    
```{python}
import pandas as pd
iris = pd.read_csv('https://raw.githubusercontent.com/mwaskom/seaborn-data/master/iris.csv')
iris
```

你还是会出错吗？有时您可能需要重新安装pip软件包，通常pip3 install pandas可以正常工作，您也可以在library(reticulate)下的r块中添加py_install("pandas")，让它安装pandas以帮助正确渲染。有时，制作简单的例子有助于将问题分解成更小的部分