在构建r包时附加python脚本

Question

我还没有为我的任务找到一些R包（相信我，没有人），但python中有一个。所以我编写了python脚本，并在一些函数中使用了reticulaye::py_run_file('my_script.py')。但在构建和安装之后，包找不到该脚本。我应该把这个脚本放在哪里，以便在安装后直接从包中使用它。还有一件事，我需要安装minicondareticulate::install_miniconda()。有人知道在install.package命令后自动安装它的方法吗

Answer 1

通常非R代码位于./inst/python/your_script.py（对于JS等也是如此）。inst文件夹中的任何内容都将被安装到包的根目录中，不会发生任何更改

要在程序包函数中调用这些文件，请使用以下命令：

reticulate::py_run_file(system.file("your_script.py", package = "yourpkg"))

见：http://r-pkgs.had.co.nz/inst.html

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对于第二个问题，您应该在安装任何东西之前提示用户，但是您通常会在一个名为.onLoad的特殊函数中使用参数libname和pkgname调用任何外部安装程序。这是一个在调用library(yourpkg)时自动执行的函数

.onLoad <- function(libname, pkgname) {
  user_permission <- utils::askYesNo("Install miniconda? downloads 50MB and takes time")

  if (isTRUE(user_permission)) {
    reticulate::install_miniconda()
    } else {
    message("You should run `reticulate::install_miniconda() before using this package")
   }
}

您可以将此函数放入任何包R文件中