将核苷酸翻译成氨基酸的Python

Question

我有一个不起作用的函数。我必须将.txt文件中的核苷酸序列翻译成氨基酸，比较字符串和字典。有人能告诉我这有什么问题吗？输出仅显示.txt文件中的字符串，它被选为该文件中的氨基酸序列

f = open('hemoglobin.txt', 'r')
sequence = f.readline()
while sequence:
    sequence = sequence.rstrip()
    print(sequence)
    sequence = f.readline()

gencode = { 'ATA':'I', 'ATC':'I', 'ATT':'I', 'ATG':'M',
    'ACA':'T', 'ACC':'T', 'ACG':'T', 'ACT':'T',
    'AAC':'N', 'AAT':'N', 'AAA':'K', 'AAG':'K',
    'AGC':'S', 'AGT':'S', 'AGA':'R', 'AGG':'R',
    'CTA':'L', 'CTC':'L', 'CTG':'L', 'CTT':'L',
    'CCA':'P', 'CCC':'P', 'CCG':'P', 'CCT':'P',
    'CAC':'H', 'CAT':'H', 'CAA':'Q', 'CAG':'Q',
    'CGA':'R', 'CGC':'R', 'CGG':'R', 'CGT':'R',
    'GTA':'V', 'GTC':'V', 'GTG':'V', 'GTT':'V',
    'GCA':'A', 'GCC':'A', 'GCG':'A', 'GCT':'A',
    'GAC':'D', 'GAT':'D', 'GAA':'E', 'GAG':'E',
    'GGA':'G', 'GGC':'G', 'GGG':'G', 'GGT':'G',
    'TCA':'S', 'TCC':'S', 'TCG':'S', 'TCT':'S',
    'TTC':'F', 'TTT':'F', 'TTA':'L', 'TTG':'L',
    'TAC':'Y', 'TAT':'Y', 'TAA':'*', 'TAG':'*',
    'TGC':'C', 'TGT':'C', 'TGA':'*', 'TGG':'W' }

def translate(sequence):
    for i in range(0, len(sequence), 3):
        codon = str(sequence[i])
        if codon == gencode['TAA', 'TAG', 'TGA']:
            print('STOP')
            break
        elif codon == gencode[key]:
            print(gencode[value])
    return()

Answer 1

更改此项：

if codon == gencode['TAA', 'TAG', 'TGA']:

致：

if codon in ['TAA', 'TAG', 'TGA']:

Answer 2

您没有调用translate()函数

while sequence:
    sequence = sequence.rstrip()
    translate(sequence)