使用xarray对非标准CFTimeIndex日历（360day，noleapyear）进行重采样以供Pandas使用的方法

Question

#60198708让我打开这个问题，因为我还没有找到好的解决方案

问题

我已经从EURO-CORDEX集合下载了几个用于每日降水通量的气候模型。虽然一些模型使用标准日历，与熊猫兼容，但其他模型，特别是MOHC HadGem2，使用360天CFTimeIndex

主要问题是，如何使用这些日历有效地对月度数据进行重新采样，以便能够协调数据并在以后生成集合统计数据

降水通量数据（2011-2015年摘录）可以如下所示 你可以下载它here

<xarray.Dataset>
Dimensions:       (bnds: 2, rlat: 412, rlon: 424, time: 1800)
Coordinates:
    lat           (rlat, rlon) float64 ...
    lon           (rlat, rlon) float64 ...
  * rlat          (rlat) float64 -23.38 -23.26 -23.16 ... 21.61 21.73 21.83
  * rlon          (rlon) float64 -28.38 -28.26 -28.16 ... 17.93 18.05 18.16
  * time          (time) object 2011-01-01 12:00:00 ... 2015-12-30 12:00:00
Dimensions without coordinates: bnds
Data variables:
    pr            (time, rlat, rlon) float32 ...
    rotated_pole  |S1 ...
    time_bnds     (time, bnds) object ...
Attributes:
    CDI:                            Climate Data Interface version 1.3.2
    Conventions:                    CF-1.6
    NCO:                            4.4.2
    CDO:                            Climate Data Operators version 1.3.2 (htt...
    contact:                        Fredrik Boberg, Danish Meteorological Ins...
    creation_date:                  2019-11-16 14:39:25
    experiment:                     Scenario experiment using HadGEM as drivi...
    experiment_id:                  rcp45
    driving_experiment:             MOHC-HadGEM2-ES,rcp45,r1i1p1
    driving_model_id:               MOHC-HadGEM2-ES
    driving_model_ensemble_member:  r1i1p1
    driving_experiment_name:        rcp45
    frequency:                      day
    institution:                    Danish Meteorological Institute
    institute_id:                   DMI
    model_id:                       DMI-HIRHAM5
    rcm_version_id:                 v2
    project_id:                     CORDEX
    CORDEX_domain:                  EUR-11
    product:                        output
    tracking_id:                    hdl:21.14103/158e462e-499c-4d6e-8462-ac3e...
    c3s_disclaimer:                 This data has been produced in the contex...

如您所见，数据集的时间维度是cftime.Datetime360Day。所有月份都是30天，这有时有利于气候预测，但对pandas来说并非如此

<xarray.DataArray 'time' (time: 1800)>
array([cftime.Datetime360Day(2011-01-01 12:00:00),
       cftime.Datetime360Day(2011-01-02 12:00:00),
       cftime.Datetime360Day(2011-01-03 12:00:00), ...,
       cftime.Datetime360Day(2015-12-28 12:00:00),
       cftime.Datetime360Day(2015-12-29 12:00:00),
       cftime.Datetime360Day(2015-12-30 12:00:00)], dtype=object)
Coordinates:
  * time     (time) object 2011-01-01 12:00:00 ... 2015-12-30 12:00:00
Attributes:
    standard_name:  time
    long_name:      time
    bounds:         time_bnds

到目前为止我所尝试的

我把CFTimeIndex转换成字符串，把它放在pandas.DataFrame上，然后用pd.to_datetime和errors=coerce来转换时间

ds = xarray.open_dataset('data/mohc_hadgem2_es.nc')

def cft_to_string(cfttime_obj):
        month = str(cfttime_obj.month)
        day = str(cfttime_obj.day)

        # This is awful but there were no two-digit months/days by default
        month = '0'+month if len(month)==1 else month
        day = '0'+day if len(day)==1 else day

        return f'{cfttime_obj.year}-{month}-{day}'

# Apply above function
ds_time_strings = list(map(cft_to_string, ds['time']))

# Get precipitation values only (to use in pandas dataframe)
# Suppose the data are from multiple pixels (for whole of Europe)
# - that's why the mean(axis=(1,2))

precipitation = ds['pr'].values.mean(axis=(1,2))

# To dataframe
df = pd.DataFrame(index=ds_time_strings, data={'precipitation': precipitation})

# Coerce erroneous dates
df.index = pd.to_datetime(df.index, errors='coerce') # Now, dates such as 2011-02-30 are omitted

这将提供一个数据帧，其中包含NaT等非标准日期，并且缺少某些日期（31天）。我不介意，因为我创建了90年跨度的预测

            precipitation
2011-01-01  0.000049
2011-01-02  0.000042
2011-01-03  0.000031
2011-01-04  0.000030
2011-01-05  0.000038
... ...
2011-02-28  0.000041
NaT         0.000055
NaT         0.000046
2011-03-01  0.000031
... ...
2015-12-26  0.000028
2015-12-27  0.000034
2015-12-28  0.000028
2015-12-29  0.000025
2015-12-30  0.000024
1800 rows × 1 columns

现在我可以使用pandas轻松地对每月数据进行重采样

虽然这似乎是可行的，但是否有一种更干净的方法仅适用于xarray/pandas？可能不是基于字符串的

• ds.indexes['time'].to_datetimeindex()在非标准日历上失败
• ds.resample(time='M')将进行重采样，但是，它会产生非标准的月末。由于ds['time'].dt.floor('M')在ValueError: <MonthEnd: n=1> is a non-fixed frequency上失败，我没有找到纠正月末的方法
• xarray.groupby(time='time.month')可以处理非标准日历，但是，它的用例是沿着不同的轴分组，这是不需要的

我肯定错过了什么，因为这是一个复杂的问题。谢谢你的帮助

Answer 1

感谢您提供的详细示例！如果您的分析可以接受每月平均数的时间序列，我认为最干净的方法是重新采样到“月开始”频率，然后协调日期类型，例如，对于由CFTimeIndex索引的数据集，类似于：

resampled = ds.resample(time="MS").mean()
resampled["time"] = resampled.indexes["time"].to_datetimeindex()

这基本上是你的第二个要点，但有一个小小的改变。重新采样到月开始频率可以避免360天日历包含标准日历（例如2月30日）中不存在的月末的问题