创建hdf5文件时出现权限错误

Question

我有以下代码段来创建hdf5文件，并使用“with”语句来确保文件正确关闭。然而，我仍然有如下错误消息

   filename = 'E30.hdf5'
   try:
        with h5py.File(filename, 'w-') as f:
            print('---')
    except: 
        os.remove(filename)
        f = h5py.File(filename, 'w-')     

然而，我仍然有如下错误消息。在工作目录中，可能已有名为“E30.hdf5”的现有文件。但这真的重要吗？我试图直接从windows中删除它。但是，windows不允许我删除它，说它正在打开

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OSError                                   Traceback (most recent call last)
<ipython-input-6-e8ccfbc1b5d2> in vid_to_hdf(En, start, end, chunk)
      9     try:
---> 10         with h5py.File(filename, 'w-') as f:
     11             print('---')

~\AppData\Local\Continuum\anaconda3\envs\fastai-py37\lib\site-packages\h5py\_hl\files.py in __init__(self, name, mode, driver, libver, userblock_size, swmr, rdcc_nslots, rdcc_nbytes, rdcc_w0, track_order, **kwds)
    407                                fapl, fcpl=make_fcpl(track_order=track_order),
--> 408                                swmr=swmr)
    409 

~\AppData\Local\Continuum\anaconda3\envs\fastai-py37\lib\site-packages\h5py\_hl\files.py in make_fid(name, mode, userblock_size, fapl, fcpl, swmr)
    176     elif mode in ['w-', 'x']:
--> 177         fid = h5f.create(name, h5f.ACC_EXCL, fapl=fapl, fcpl=fcpl)
    178     elif mode == 'w':

h5py\_objects.pyx in h5py._objects.with_phil.wrapper()

h5py\_objects.pyx in h5py._objects.with_phil.wrapper()

h5py\h5f.pyx in h5py.h5f.create()

OSError: Unable to create file (unable to open file: name = 'E30.hdf5', errno = 17, error message = 'File exists', flags = 15, o_flags = 502)

During handling of the above exception, another exception occurred:

PermissionError                           Traceback (most recent call last)
<timed eval> in <module>

<ipython-input-6-e8ccfbc1b5d2> in vid_to_hdf(En, start, end, chunk)
     11             print('---')
     12     except:
---> 13         os.remove(filename)
     14         f = h5py.File(filename, 'w-')
     15     # Create dataset within file

PermissionError: [WinError 32] The process cannot access the file because it is being used by another process: 'E30.hdf5'

Answer 1

您同时遇到多个问题。 首先，让我们从h5py.File()access_mode标志开始

• w-：创建文件，如果存在则失败（避免意外覆盖现有文件）
• w：创建文件，如果存在则截断（表示它覆盖现有文件）
• r+：读/写，文件必须存在（用于打开现有文件以写入数据）

在下面的逻辑中，如果E30.hdf5不存在，则try:/except:模式将执行try:语句。如果存在E30.hdf5，它将执行except:语句

每个分支都有不同的h5py.File()方法，这使问题变得复杂。您的try:分支使用with h5py.File() as f:方法。因此，当代码执行此逻辑时，文件将在末尾完全关闭（没有f.close()语句）

但是，您的except:分支使用f=h5py.File()。因此，当代码执行此逻辑时，需要一个f.close()语句来确保最后的闭包

这就是我认为您正在经历的情况：

1. 我假设E30.hdf5在您第一次运行代码时不存在
2. 因此，第一次运行时，您将通过try:分支，文件在末尾被干净地关闭
3. 下次运行代码时，E30.hdf5存在，因此，您将通过except:分支。因此，该文件在进程结束时没有关闭，其他进程无法访问它（Python或OS）

编码建议：

您的except:块具有相同的行为mode=w。下面的代码的行为相同，并且在进程完成时将始终关闭文件。此外，它更具可读性（IMHO）。注意：如果存在E30.hdf5，两种方法都会删除它

filename = 'E30.hdf5'
with h5py.File(filename, 'w') as f: # use mode=w
     print(' -')

如果迫切需要保持try:/except:模式，则进行此更改：（使用try:/except:作为访问模式w-和r+而不使用os.remove(filename)非常有用。）

filename = 'E30.hdf5'
try:
    with h5py.File(filename, 'w-') as f:
        print(' -')
except: 
    os.remove(filename)
    with h5py.File(filename, 'w-') as f:
         print('+++')