我已经克隆了一个git回购,现在它在我的机器上是本地的。
在路径Pipes/Filtering
中有一个名为filter_pileup_by_site_list.py
的脚本,我正在尝试使用它,它是一个docopt CLI,因此我将转到上面提到的目录,并在终端中键入以下内容:python filter_pileup_by_site_list.py Filter_pileup_by_site <parameters>
脚本从repo中的另一个目录导入一个类,其路径为:Pipes/Utility
。
我上面编写的命令失败并返回以下错误:
File "filter_pileup_by_site_list.py", line 16, in <module>
from Utility.Pileup_class import Pileup_line
ModuleNotFoundError: No module named 'Utility'
我遇到的所有解决方案都与PYTHONPATH有关,所以我编辑了它,现在当我在终端echo $PYTHONPATH
中键入时,我得到了/Pipes:/Pipes/Utility:/Pipes/Filtering:/Pipes/:/Bigdata/bioinf/Pipes3:/Bigdata/bioinf/Pipes:/Bigdata/users/eliran/Pipes
它仍然返回我以前的回溯轨迹
如果真的有什么关系的话,我正在使用LinuxMint
有效的解决方案:
在脚本顶部添加以下行:
下面的工作原理是因为默认情况下python只在本地文件夹中查找文件,所以我必须添加上面的行,告诉它在上一个文件夹中搜索,以便它可以找到
Utility
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