使用Owlready2在OWL/rdf本体中检索rdf标签

2024-05-13 03:10:08 发布

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我正在从事一个项目,在这个项目中,我需要检索rdf:人类/鼠标本体的标签值,并在这些标签上运行匹配器。然而,我似乎找不到一个内置的Owlready2方法可以返回本体中所有类的所有标签。我可以使用onto.classes()获取所有类名,但这对我没有帮助,因为我无法从类名获取标签。类名在数据集中只有human.NCIXXXXX.格式的IRI

我正在使用OAEI 2012数据集,该数据集采用OWL/RDF格式:http://oaei.ontologymatching.org/2012/anatomy/index.html (数据集的下载链接位于数据集标题下)

以下是人类owl本体文件的一个片段:

<owl:Class rdf:about="http://human.owl#NCI_C33648">
    <rdfs:label rdf:datatype="http://www.w3.org/2001/XMLSchema#string">Subiculum</rdfs:label>
    <rdfs:subClassOf rdf:resource="http://human.owl#NCI_C13031"/>
    <rdfs:subClassOf>
        <owl:Restriction>
            <owl:onProperty rdf:resource="http://human.owl#UNDEFINED_part_of"/>
            <owl:someValuesFrom rdf:resource="http://human.owl#NCI_C12353"/>
        </owl:Restriction>
    </rdfs:subClassOf>
    <oboInOwl:hasRelatedSynonym rdf:resource="http://human.owl#genid6200"/>
</owl:Class>

onto.classes()返回human.NCI_C13031。我想要Python列表中“subculum”的标签值

owlready2文档说明可以通过调用onto.search(label = "XXXXXX") (X = labelname)来检索基于指定标签的实体对象。然而,我想要相反的结果。我需要重新检查标签。我似乎找不到使用owlready2实现这一点的方法。有没有一种方法可以在有/没有OWLEADY2的情况下实现这一点?我知道owlready2中有一个OWL/RDF解析器(owlready没有),我可以成功地读取该文件。我只需要一个特定的标签查询就可以了

请考虑我需要用Python来做这件事,我对Python也是非常新的。我尝试了ontospy,但它似乎没有本体查询的潜力,只是用于本体文档(如果我错了,请纠正我)

谢谢

编辑:我自己解决了。要获取标签,可以将set render function 设置为自定义定义的函数,该函数接受实体并返回其标签。所有这些都在owlready文档中:https://pythonhosted.org/Owlready2/annotations.html#custom-rendering-of-entities` `


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