如何在Python文本文件中找到某个字符串的行号？

Question

我编写了一个Python脚本，它打开了一个包含质谱数据的csv文件列表，使用Numpy.genfromtxt收集数据，使用statsmodels基于这些数据进行计算，并将结果返回到一个已编译的excel文件中。 在CSV文件中，根据实验的运行条件，标题和内部结构的大小可能不同

现在我使用configparser读取的配置文件，并针对不同的实验条件使用不同的配置文件。然而，这是相当笨重

我想做的是测量数据帧的头大小和长度，而不是从配置文件中读取它。每个同位素的数据以字符串开头，例如：

*#ISOTOPE, 'Ar36:L2S1'* and *#ISOTOPE, 'Ar37:L1S1'*

然后是每个同位素的数据（3列），例如：

*#ISOTOPE, 'Ar36:L2S1'*

No, Time, Intensity

1, 101.4685919, 1.845379369941e-003

2, 102.4901003, 2.153738546096e-003

.....

599, 701.1342959, 2.087938052439e-003

600, 702.1343039, 2.000204060898e-003

(blank line)

*#ISOTOPE, 'Ar37:L1S1'*

No, Time, Intensity

1, 101.4685919, -1.103785922163e-004

2, 102.4901003, 3.526673114000e-004

等等

我想确定每个同位素的数据行数和数据长度

然后，当我尝试导入整个数据文件而不忽略标题（计算行索引）时，会出现与列数相关的错误。我尝试使用usecols=1忽略其余部分，但这不起作用。（valueerror）

我假设有一个简单的解决方案，但我的编程技能到目前为止还不是很好

有人能帮忙吗

干杯

Answer 1

好的，马斯克林给我指出了正确的方向。以下代码返回我要查找的节的索引：

FileList = (glob.glob("*.csv"))
for FileToProcess in FileList:
        with open(FileToProcess) as readfile:
            for cnt, line in enumerate(readfile):
                if "#ISOTOPE" in line:
                    print("Line {}:{}".format(cnt, line))
        readfile.close

非常感谢

Answer 2

这并不完全清楚，但我的理解是，在一个文件中有一组CSV-ish数据集，每个文件都有一个标题行（以*#ISOTOPE开头）和一个空白的“页脚”行

根据大小，一个选项可能是以基本方式（使用open内置）打开文件，然后循环：

• 处理魔法头（读取一行并解析该行）
• 将所有内容复制到临时文件或StringIO，直到第一个空行
• 将tempfile或StringIO解析为CSV，按常规处理

重复此操作，直到文件结束