从xarray数据集中的某些变量中删除维度

Question

我有一个xarray数据集，其中一些变量的维数超出了需要（例如，“纬度”和“经度”变量也随时间变化的3D数据集）。如何删除额外的维度

例如，在下面的数据集中，“bar”是沿x和y轴的二维变量，沿x轴具有常量值。如何从'bar'而不是'foo'中删除x维度

>>> ds = xr.Dataset({'foo': (('x', 'y'), np.random.randn(2, 3))},
                    {'x': [1, 2], 'y': [1, 2, 3],
                     'bar': (('x', 'y'), [[4, 5, 6], [4, 5, 6]])})
>>> ds
<xarray.Dataset>
Dimensions:  (x: 2, y: 3)
Coordinates:
  * x        (x) int64 1 2
  * y        (y) int64 1 2 3
    bar      (x, y) int64 4 5 6 4 5 6
Data variables:
    foo      (x, y) float64 -0.9595 0.6704 -1.047 0.9948 0.8241 1.643

Answer 1

删除额外维度的最直接方法（使用索引）会产生一条稍微令人困惑的错误消息：

>>> ds['bar'] = ds['bar'].sel(x=1)
ValueError: dimension 'x' already exists as a scalar variable

问题是，在xarray中进行索引时，它会将索引坐标保持为标量坐标：

>>> ds['bar'].sel(x=1)
<xarray.DataArray 'bar' (y: 3)>
array([4, 5, 6])
Coordinates:
    x        int64 1
  * y        (y) int64 1 2 3
    bar      (y) int64 4 5 6

这通常很有用，但在这种情况下，当您尝试在原始数据集上设置标量坐标时，索引数组上的标量坐标'x'与非标量坐标（和维度）'x'冲突。因此会出现xarray错误，而不是重写变量

要解决这个问题，需要在索引后删除标量'x'。在当前版本的xarray中，可以使用drop执行此操作：

>>> ds['bar'] = ds['bar'].sel(x=1).drop('x')
>>> ds
<xarray.Dataset>
Dimensions:  (x: 2, y: 3)
Coordinates:
  * x        (x) int64 1 2
  * y        (y) int64 1 2 3
    bar      (y) int64 4 5 6
Data variables:
    foo      (x, y) float64 -0.9595 0.6704 -1.047 0.9948 0.8241 1.643

在xarray的未来版本（v0.9及更高版本）中，您将能够在通过写入drop=True进行索引时删除坐标，例如ds['bar'].sel(x=1, drop=True)