基于python/datafram中单元格的文本内容选择(无索引)列

2024-05-13 13:49:19 发布

您现在位置:Python中文网/ 问答频道 /正文

TL:DR-如何基于包含特定文本段的列,从现有非索引数据帧中的一列或多列创建数据帧/系列?

对Python和数据分析比较陌生(这是我第一次发布关于堆栈溢出的问题,但我已经寻找了很长一段时间的答案(并且习惯于定期编写代码),但没有任何成功

我从一个没有命名/索引列的Excel文件导入了一个数据帧。我正试图成功地从这些文件中提取数据,这些文件都有稍微不同的数据列(当然-为什么要使它简单。。。或者遵循模板。。。或者只是使用格式不好的Excel电子表格以外的东西

原始数据帧(来自结构不良的XLS文件)看起来有点像这样:

0                                       NaN             RIGHT      NaN   
1                                      Date              UCVA      Sph   
2                       2007-01-13 00:00:00              6/38  [-2.00]   
3                       2009-11-05 00:00:00               6/9      NaN   
4                       2009-11-18 00:00:00              6/12      NaN   
5                       2009-12-14 00:00:00               6/9  [-1.25]   
6                       2018-04-24 00:00:00           worn CL  [-5.50]   

           3     4      5                 6     7     8        9   \
0         NaN   NaN    NaN               NaN   NaN   NaN      NaN   
1         Cyl  Axis  BSCVA  Pentacam remarks    K1    K2  K2 back   
2     [-2.75]    65    6/9               NaN   NaN   NaN      NaN   
3         NaN   NaN    NaN               NaN   NaN   NaN      NaN   
4         NaN   NaN    6/5         Pentacam     46  43.9     -6.6   
5     [-5.75]    60  6/6-1               NaN   NaN   NaN      NaN   
6     [+7.00}   170  6/7.5               NaN   NaN   NaN      NaN   

           ...              17                18    19    20       21     22  \
0          ...             NaN               NaN   NaN   NaN      NaN    NaN   
1          ...           BSCVA  Pentacam remarks    K1    K2  K2 back  K max   
2          ...             6/5               NaN   NaN   NaN      NaN    NaN   
3          ...             NaN               NaN   NaN   NaN      NaN    NaN   
4          ...             NaN          Pentacam  44.3  43.7     -6.2   45.5   
5          ...           6/4-4               NaN   NaN   NaN      NaN    NaN   
6          ...             6/5               NaN   NaN   NaN      NaN    NaN   

我想提取一组数据帧/序列,然后将它们组合在一起,得到一个“整洁”的数据帧,例如:

1                                      Date              R-UCVA      R-Sph   
2                       2007-01-13 00:00:00              6/38  [-2.00]   
3                       2009-11-05 00:00:00               6/9      NaN   
4                       2009-11-18 00:00:00              6/12      NaN   
5                       2009-12-14 00:00:00               6/9  [-1.25]   
6                       2018-04-24 00:00:00           worn CL  [-5.50]   

1       R-Cyl R-Axis R-BSCVA  R-Penta          R-K1   R-K2  R-K2 back   
2     [-2.75]    65    6/9               NaN   NaN   NaN      NaN   
3         NaN   NaN    NaN               NaN   NaN   NaN      NaN   
4         NaN   NaN    6/5         Pentacam     46  43.9     -6.6   
5     [-5.75]    60  6/6-1               NaN   NaN   NaN      NaN   
6     [+7.00}   170  6/7.5               NaN   NaN   NaN      NaN  

等等。等等。所以我试着写一些代码,通过查找单词“Date”或“UCVA”等来提取一系列列,然后我计划将它们重新缝合到一个单独的数据框中,并将patient identifier作为一个额外的列。然后循环浏览所有的XLS文件,将所有文件添加到一个CSV文件中,然后我就可以对其进行有用的操作(比如放入Access数据库-是的,我知道,但它必须易于使用,并且已经安装在NHS计算机上-和统计分析)

有什么建议吗?我希望这是足够的信息

非常感谢

谨致问候 维姬


Tags: 文件数据代码datebackk2k1nan
1条回答
网友
1楼 · 发布于 2024-05-13 13:49:19

这里有一个东西,希望能让你开始。 我准备了一个text.xlsx文件: Excel file 我可以这样读

    path = 'text.xlsx'

    df = pd.read_excel(path, header=[0,1])

    # Deal with two levels of headers, here I just join them together crudely 
    df.columns = df.columns.map(lambda h: '  '.join(h))

    # Slight hack because I messed with the column names
    # I create two dataframes, one with the first column, one with the second column
    df1 = df[[df.columns[0],df.columns[1]]]
    df2 = df[[df.columns[0], df.columns[2]]]

    # Stacking them on top of each other
    result = pd.concat([df1, df2])
    print(result)

    #Merging them on the Date column
    result = pd.merge(left=df1, right=df2, on=df1.columns[0])
    print(result)

这就产生了输出

  RIGHT  Sph RIGHT  UCVA       Unnamed: 0_level_0  Date
0        NaN              6/38      2007-01-13 00:00:00
1        NaN              6/37      2009-11-05 00:00:00
2        NaN              9/56      2009-11-18 00:00:00
0    [-2.00]               NaN      2007-01-13 00:00:00
1        NaN               NaN      2009-11-05 00:00:00
2        NaN               NaN      2009-11-18 00:00:00

以及

  Unnamed: 0_level_0  Date RIGHT  UCVA       RIGHT  Sph
0      2007-01-13 00:00:00              6/38    [-2.00]
1      2009-11-05 00:00:00              6/37        NaN
2      2009-11-18 00:00:00              9/56        NaN

一些指针: 如何合并两个标题行?参见this问答

如何有条件地选择列?参见thisthis

如何合并数据帧?熊猫馆有一个很好的导游

相关问题 更多 >