Mygene显示AttributeError，即使代码与handb相同

Question

我正在尝试为我的RNA-seq-EdgeR输出获取Entrezgene名称。我找到了mygene，并认为我应该尝试一下，但不管我做了什么（在家庭系统和服务器上尝试过），我都会遇到以下错误：

import mygene as mg
import pandas as pd
data = pd.read_csv("EdgeR-results.csv", header=0)
col_a = list(data.GeneID)
out = mg.querymany(col_a, scopes='ensembl.gene', fields='entrezgene', species='human')

回溯（最近一次调用last）：文件“”，第1行，在 AttributeError:“module”对象没有“querymany”属性

仅使用键入的列表进行尝试：

mg.getgenes(['ENSG00000176658.17','ENSG00000085224.22','ENSG00000112562.18','ENSG00000184347.14','ENSG00000183117.19','ENSG00000149218.5','ENSG00000123572.17','ENSG00000146938.16','ENSG00000206195.10'], fields="entrezgene")

回溯（最近一次呼叫）： 文件“”，第1行，在 AttributeError:“module”对象没有属性“getgenes”

我不知所措。这段代码直接来自几个手册和教程。有人能帮我吗？我有成千上万的集成基因ID，我需要转换并以某种方式合并回我的数据帧

谢谢

Answer 1

在查询前添加以下内容：

mg = mygene.MyGeneInfo()

我只是遇到了同样的错误，并在其他人的示例代码中发现了这个片段。它为我解决了这个错误