2024-05-28 23:36:08 发布
网友
Ruffus管道文档似乎假设一个人的代码和数据在同一个目录中。所有示例都有输入和输出文件说明符,没有任何相对路径。如果要转换的文件不在当前目录中,应该如何修改下面的语法?你知道吗
@transform(map_dna_sequence, # Input = previous stage suffix(".sam"), # suffix = .sam ".bam")
Ruffus的lastest version允许您输出到新目录:
@transform(map_dna_sequence, # Input = previous stage suffix(".sam"), # suffix = .sam ".bam", output_dir = "/path/to/a/new_directory")
否则,可以使用formatter()或regex而不是suffix更改目录。这两种语言都非常强大,但语法更复杂。。。你知道吗
suffix
顺便说一句,这是一个好主意,张贴在鲁弗斯新闻组以及。你知道吗
Ruffus的lastest version允许您输出到新目录:
否则,可以使用formatter()或regex而不是
suffix
更改目录。这两种语言都非常强大,但语法更复杂。。。你知道吗顺便说一句,这是一个好主意,张贴在鲁弗斯新闻组以及。你知道吗
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