我在一个文件夹中有30个fastq文件,我想知道在其中的哪个文件中可以找到一个特定的适配器(这样我就可以找出它实际上是哪个示例)。你知道吗
我写了一个很小的biopython脚本,但它只允许我一次查看一个文件,我想计算每个文件同时出现的次数。有人能帮我改进剧本吗?你知道吗
from Bio import SeqIO
adaptor = (rec for rec in \
SeqIO.parse("file.fastq", "fastq") \
if rec.seq.startswith("TGA"))`
count = SeqIO.write(adaptor, "adaptor.fastq", "fastq")
print("Saved %i adaptor" % count)
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