R如何获取从Python传递的参数

Question

我想从Python运行R脚本。下面的脚本在没有“+args”时工作。有人知道传递参数有什么问题吗？你知道吗

Python脚本：

import subprocess

Iterations = 10
command = 'C:/Program Files/R/R-3.4.3/bin/Rscript.exe'
path2script = 'C:/Users/a0266997/Documents/PossionDistribution.R'
args = [str(Iterations)]
cmd = [command, path2script] + args
subprocess.Popen(cmd)

R脚本：

myArgs <- commandArgs(trailingOnly = TRUE)
Iterations = myArgs[0]
Iterations

do something in R ....

Answer 1

这是你的代码与一些更正，应该为你工作。我还将R代码更改为可复制的代码（例如，打印到stdout和stderr）。你知道吗

我将subprocess.Popen(cmd)调用更改为subprocess.Popen(cmd, stdout = subprocess.PIPE, stderr = subprocess.PIPE)，这将修复部分问题。R代码中也有一个补丁。你知道吗

import subprocess

Iterations = 10
command = 'C:/Program Files/R/R-3.4.3/bin/Rscript.exe'
path2script = 'C:/Users/a0266997/Documents/PossionDistribution.R'
args = [str(Iterations)]
cmd = [command, path2script] + args
p = subprocess.Popen(cmd, stdout = subprocess.PIPE, stderr = subprocess.PIPE)
results = p.communicate()

R脚本（代码的修改版本）

这已myArgs[0]更改为myArgs[1]

myArgs <- commandArgs(trailingOnly = TRUE)
Iterations = myArgs[1]
write(paste0("stdout: ", Iterations),  file = stdout())
write("stderr",                        file = stderr())

我在Mac操作系统上运行了这个，它对我有用。它至少应该让你朝着正确的方向开始，这取决于你需要的细节。你知道吗