未定义的符号错误导入Cython模块

Question

我想让我的一个c++类成为Python模块。类在头Foo.h中声明，并在.cpp Foo.cpp中实现。 （g++-4.5，Ubuntu x86_64）。这是一个非常简单的课程：

Foo.cpp：

Foo::Foo() : alfa(1.0), beta(1)
{

}

Foo::~Foo()
{
}

Foo.h：

 class Foo
 {
 public:

  Foo()
  Foo(const Foo& orig);
  ~Foo();
  double alfa;
  int beta; 
 };

我创建了一个setup.py，如Cython教程所示：

setup.py

from distutils.core import setup
from distutils.extension import Extension
from Cython.Distutils import build_ext

setup(
  name = 'MyDemo',
  ext_modules=[
    Extension("Foo"
          sources=["Foo.pyx"], 
          include_dirs=[".","../eigen/"],
          language="c++"),
    ],
  cmdclass = {'build_ext': build_ext},
)

按照cython教程的说明编写我的cython模块：

Foo.pyx

cdef extern from "Foo.h":
    ctypedef struct c_Foo "Foo":
        double alfa
    c_Foo *new_Foo "new Foo" ()
    void del_Foo "delete" (c_Foo *myfoo)

cdef class Foo:
    cdef c_Foo *thisptr      # hold a C++ instance which we're wrapping
    def __cinit__(self):
         self.thisptr = new_Foo()
    def __dealloc__(self):
         del_Foo(self.thisptr)

我用以下命令编译它： python setup.py build_ext --inplace

running build_ext
skipping 'Foo.cpp' Cython extension (up-to-date)
building 'Foo extension
gcc -pthread -fno-strict-aliasing -DNDEBUG -g -fwrapv -O2 -Wall -Wstrict-prototypes -fPIC -I. -I../eigen/ -I/usr/include/python2.6 -c Foo.cpp -o build/temp.linux-x86_64-2.6/Foo.o
cc1plus: warning: command line option "-Wstrict-prototypes" is valid for Ada/C/ObjC but not for C++
g++ -pthread -shared -Wl,-O1 -Wl,-Bsymbolic-functions build/temp.linux-x86_64-2.6/Foo.o -o /home/linello/prova/Foo.so

现在创建了Foo.so共享库对象，但是当我想从python导入它时，我得到：

 >>> import Foo
      Traceback (most recent call last):
      File "<stdin>", line 1, in <module>
      ImportError: ./Foo.so: undefined symbol: _ZN4FooD1Ev
>>> 

我认为，ZN4FooD1Ev是Foo构造函数的损坏名称，但不理解该符号是如何丢失的。

我真的不明白共享对象文件中缺少什么符号。 作为第二点，在python setup.py build_ext --inplace命令之后，我的Foo.cpp文件被弄乱了，包含了cythodized版本。

如何以另一种格式（例如.cxx）重命名cythonized文件并避免链接器错误？

然后我修改了pFoo.pyx中的Foo.pyx，并修改了setup.py，现在在setup命令之后，我得到了Foo.cxx中pFoo.pyx的cythonized版本，但是当我尝试导入时，得到了

ImportError: dynamic module does not define init function (initpyFoo)

我的设置有什么问题，怎么可能解决我的问题？

Answer 1

我建议您为cython模块使用不同的名称，例如cFoo，以避免名称冲突问题：

from distutils.core import setup
from Cython.Build import cythonize

setup(ext_modules = cythonize(
           "cFoo.pyx",                 # our Cython source
           sources=["Foo.cpp"],        # additional source file(s)
           language="c++",             # generate C++ code
      ))

< P>定义C++类，使用“CPPPCYPE”关键字，如下：

cdef extern from "Foo.h":
    cdef cppclass Foo:
        Foo()
        double alfa
        int beta

然后您应该能够像这样访问您的类：

cdef Foo *foo = new Foo()
foo.beta = 42