Pandas DataFrame中的计算列
我用以下代码创建了一个数据框:
data_series = {}
while not q.empty():
(name, data_dict) = q.get()
data_series[name] = pd.Series(data_dict)`
data_frame = pd.DataFrame(data_series)
#data_dict is of the format { MD5: [time_as_float1, time_as_float2] }
#I have multiple data_dicts stored in a queue (created by multiple worker threads)
我想要实现的目标大致是这样的:
1. 对于每个MD5,输出一下flog
、hlog
和slog
各自花了多少时间。(通过计算对应的time_as_float2和time_as_float1的差值)2. 对于每个
hlog
和flog
,显示他们第一次看到某个MD5的时间(也就是最小的time_as_float1)和最后一次看到某个MD5的时间(也就是最大的time_as_float2)
数据框:
索引:395条记录,从0037B4F499705D725C2B3B00956B574E到FF11433CC64568110D3AD46037290725
数据列(总共3列):
flog 220个非空值
hlog 175个非空值
slog 20个非空值
数据类型:对象(3)
(Pdb) data_frame['hlog']
0037B4F499705D725C2B3B00956B574E [1401808481.57, 1401808481.7]
016E73F1038CE46AF4A619453AC7DE70 [1401808491.38, 1401808491.51]
0250F3B15665E8B00F7D58CCA8C2C8F4 NaN
0260FA375596B150DF8B4D7E3CA2D934 NaN
03173B333E22CE63F6485AC87D616878 [1401808482.36, 1401808482.49]
我甚至不确定我构建数据框的方式是否正确,因为我觉得我的需求这么简单,应该是默认就能支持的。
1 个回答
你说得对,你构建数据框的方式不是很好。可以尝试利用pandas和numpy之间的强大互动。
我先创建数据框(在开始时就应该知道你会有多少行,这样性能会更好),然后再逐行填充数据。这个部分我无法改进,因为我没有python 3和queue
。
# first initialize dataframe
data_frame = pd.DataFrame(columns=['type', 'hash', 't0', 't1'], index=np.arange(10))
# this is now what would have to be inside the queue loop
data_dict = {'type': name, 'hash':md5hash,
't0': times[0], 't1': times[1]}
name = "hlog"
data_series = pd.Series(data_dict)
data_frame.loc[0] = data_series
data_series[['t0', 't1']] += 0.5 # now I just quickly "fake" an additional loop to create more data
data_frame.loc[1] = data_series
现在我的数据集看起来是这样的:
type hash t0 t1
0 hlog MD5 0.1 0.2
1 hlog MD5 0.6 0.7
2 NaN NaN NaN NaN
3 NaN NaN NaN NaN
(...)
所以现在,拥有单独的t0
和t1
列后,你的第一个问题就变得非常简单了:
data_frame['time-it-took'] = data_frame['t1'] - data_frame['t0']
第二个问题在这里也经常被回答:这是一种典型的groupby-apply组合,你可以在文档中找到很多相关信息:
# 设置索引:类型
data_frame.set_index(['type'], inplace=True)
# 按类型分组,并将最小的to
作为值
data_frame['first-time'] = data_frame.groupby(level=0).apply(lambda x: x['t0'].min())
现在我的数据看起来是这样的(索引仍然设置为哈希类型):
hash t0 t1 time-it-took first-time
type
hlog MD5 0.1 0.2 0.1 0.1
hlog MD5 0.6 0.7 0.1 0.1
NaN NaN NaN NaN NaN NaN
一旦你理解了这里发生了什么,我相信你可以用同样的方法找到't1'的最大值。
再次强调,关键是要正确设置数据框,这一点你应该多花时间去做。试着考虑一下你的数据应该以什么样的方式结构化才最合理。