在Python中使用“igraph”读取加权图

Question

我需要从外部文件读取一个带权重的图。

在其他帖子中推荐使用ncol格式，但我试过“ncol”格式，结果不行：

g = igraph.Graph.Read_Ncol("small.ncol")
for vertex in g.vs():
    print vertex["weight"]

small.ncol

0   1   0.47
2   0   0.67
2   1   0.94
3   0   0.98
3   1   0.05
3   2   0.24
4   0   0.12
4   1   0.22
4   2   0.36
4   3   0.69
5   0   0.82
6   5   0.97
7   5   0.43
7   6   0.83
8   5   0.44
8   6   0.49
8   7   0.39
9   5   0.37
9   6   0.55
9   7   0.73
9   8   0.68
10  0   0.34
11  10  0.22
12  11  0.40
13  12  0.78
14  10  0.59
14  13  0.81

输出：

Traceback (most recent call last):
  File "stackoverflow.py", line 54, in <module>
    print vertex["weight"]
KeyError: 'Attribute does not exist'

我尝试从Nexus读取带权重的图：

例如：这是一个带权重的图：http://nexus.igraph.org/api/dataset_info?format=xml&id=1

<id>1</id>
<sid>karate</sid>
<tags>
    <tag>social network</tag>
    <tag>undirected</tag>
    **<tag>weighted</tag>**
</tags>

但这也不行：

g = igraph.Nexus.get("karate")
for vertex in g.vs():
    print vertex["weight"]

输出：

Traceback (most recent call last):
  File "stackoverflow.py", line 54, in <module>
    print vertex["weight"]
KeyError: 'Attribute does not exist'

我不知道怎么读取带权重的图，有人能帮忙吗？

Answer 1

你想要读取图中顶点的权重，但在这些图里，权重其实是对应于边的：

g = igraph.Nexus.get("karate")
for edge in g.es:
    print edge["weight"]