在Ubuntu中安装rpy2时出错

Question

我在Ubuntu 13.10上安装rpy2的时候遇到了问题，每次运行时都会出现以下错误：

pip install r2py
    Downloading/unpacking rpy2
  Downloading rpy2-2.3.9.tar.gz (187kB): 187kB downloaded
  Running setup.py egg_info for package rpy2

    "/usr/lib/R/bin/R" CMD config --ldflags
    Invalid substring
    -fopenmp
    in string
    -Wl,--export-dynamic -fopenmp  -L/usr/lib/R/lib -lR -lpcre -llzma -lbz2 -lrt -ldl -lm
    Problem while running `"/usr/lib/R/bin/R" CMD config --ldflags`

    Complete output from command python setup.py egg_info:
    running egg_info

creating pip-egg-info/rpy2.egg-info

writing pip-egg-info/rpy2.egg-info/PKG-INFO

writing top-level names to pip-egg-info/rpy2.egg-info/top_level.txt

writing dependency_links to pip-egg-info/rpy2.egg-info/dependency_links.txt

writing manifest file 'pip-egg-info/rpy2.egg-info/SOURCES.txt'

warning: manifest_maker: standard file '-c' not found



"/usr/lib/R/bin/R" CMD config --ldflags

Invalid substring

-fopenmp

in string

-Wl,--export-dynamic -fopenmp  -L/usr/lib/R/lib -lR -lpcre -llzma -lbz2 -lrt -ldl -lm

Problem while running `"/usr/lib/R/bin/R" CMD config --ldflags`



----------------------------------------
Cleaning up...
Command python setup.py egg_info failed with error code 1 in /tmp/pip_build_root/rpy2
Storing complete log in /home/sina/.pip/pip.log

我尝试从源代码安装这个软件包，但还是遇到同样的错误。

有没有人能帮我解决这个问题？

谢谢！

Answer 1

这个问题可能会在以后的版本中修复：

点击这里查看修复的详细信息

来源于这里：关于 rpy2、R 和 Ubuntu 12.04 的问题 - 无效的子字符串 -fopenmp

Answer 2

这个问题在 rpy2 2.3.10 版本中已经修复了。你可以在 pypi 上找到这个版本。