绘制大型networkx图：数组太大

Question

我正在尝试用networkx画一个带有权重边的图，但现在遇到了一些困难。

正如标题所说，这个图真的很大：

节点数量： 103362
边的数量： 1419671

当我用以下代码尝试绘制这个图时：

pos = nx.spring_layout(G)
nx.draw(G, node_color='#A0CBE2',edge_color='#BB0000',width=2,edge_cmap=plt.cm.Blues,with_labels=False)
plt.savefig("edge_colormap.png") # save as png
plt.show() # display

（这只是我在测试功能，并不是我想要的最终结果）。我遇到了一个错误：

ValueError: 数组太大了。

这个错误是由spring_layout算法引发的。你知道是什么原因吗？即使我使用不同的布局算法，还是会出现同样的错误，我该如何避免这个问题（如果可以的话）？

另外，我想根据边的权重来给它们上色。正如你所看到的，边的数量很多，权重范围也可能很广，最好的做法是什么呢？

谢谢你的耐心。

我在评论中补充：

我正在尝试调查我数据的密度。基本上，我在查看50,000场比赛，每场比赛有10名玩家，每当两名玩家在比赛中相遇时，我就把它们之间的边的权重加1。我的想法是，最终结果能显示出我的数据集的强度。在我心中，我希望最重的边在中心，随着我们从中心向外移动，数据的连接就会变得稀疏。

Answer 1

问题出在使用spring_layout这个方法上。因为节点太多了，计算它们之间的位置会花费一些时间。如果节点数量这么多，我建议你要么自己计算每个节点的x和y坐标，要么把图分成更小的子图来画。（最好少于5000个节点，不然你的电脑可能会变得有点慢。）

这是一个包含1000个节点的erdos_renyi_graph（随机选择的边）效果图。

图中突出了两个节点。

接下来是1500个节点的效果图： 这次细节多了一些，现在有7到8个有趣的节点。

在图中有这么多边和节点，其实收获不大。如果你对结果不满意，还得重新运行一遍。

如果你想获取每个节点的x和y坐标，可以看看这个链接：在NetworkX中显示节点在确切的(x,y)位置，结果是旋转的