如何防止Matplotlib裁剪我的坐标轴标签？

Question

我正在为一篇科学论文准备一些图表，这些图表需要宽而短，以便符合页面限制。不过，当我把它们保存为pdf格式时，x轴的标签消失了，因为（我想）它们超出了边界框。

在iPython笔记本中输入以下内容就能重现这个问题。

%pylab inline
pylab.rcParams['figure.figsize'] = (8.0, 2.0)
plot([1,5,2,4,6,2,1])
xlabel("$x$")
ylabel("$y$")
savefig("test.pdf")

生成的pdf文件看起来是这样的：

我该如何改变pdf文件的边界框呢？理想情况下，我希望有一个“正确”的解决方案，也就是自动调整大小，让所有内容都能整齐地放下，包括去掉左右两边多余的空白。不过我现在有点着急，所以只要能找到任何方法来改变边界框就行，如果需要的话，我会猜测一些数字直到看起来合适为止。

Answer 1

如果你正在为科学论文准备图表，我建议你自己来进行“裁剪”，可以使用

plt.subplots_adjust(left,right,bottom,top,..)

在创建图形后、保存之前进行操作。如果你是在ipython控制台运行的，也可以在生成图形后调用subplots_adjust，通过反复试验来调整边距。有些后端（我想至少Qt后端）还提供了一个图形界面来实现这个功能。

手动操作虽然需要时间，但大多数情况下能得到更精确的结果，尤其是我在使用Latex排版时的经验。

每当你需要将两个图形垂直或水平堆叠（比如使用subfigure这样的包）时，这都是唯一的选择，因为tight_layout无法保证两个图形的边距一致，导致坐标轴在论文中对不齐。

这是一个很好的链接，介绍了如何使用matplotlib进行出版，举例说明了如何设置图形宽度以匹配期刊的列宽。

Answer 2

经过一番搜索，我找到了解决办法：你可以在 savefig 命令中加上 bbox_inches='tight'，这样它会自动调整边框的大小，让它刚好包住内容：

%pylab inline
pylab.rcParams['figure.figsize'] = (8.0, 2.0)
plot([1,5,2,4,6,2,1])
xlabel("$x$")
ylabel("$y$")
savefig("test.pdf",bbox_inches='tight')

这些边框的尺寸真是刚刚好。

需要注意的是，这和Ffisegydd的回答稍有不同，因为它是调整边框来适应图形，而不是改变图形来适应边框。（不过这两种方法对我来说都没问题。）

Answer 3

你可以使用 plt.tight_layout() 这个命令来让 matplotlib 自动调整你图表的布局。tight_layout() 会自动调整图表的大小和形状，特别是在你有重叠的标签、刻度等情况时，它会很有用。

%pylab inline

pylab.rcParams['figure.figsize'] = (8.0, 2.0)

plot([1,5,2,4,6,2,1])

xlabel("$x$")
ylabel("$y$")

tight_layout()

savefig("test.pdf")

这里有一个输出的 .png 图片（虽然不能在 StackOverflow 上传 pdf 文件，但我检查过，pdf 的效果是一样的）。