如何在Pandas中对DataFrame进行复杂条件的内连接或外连接

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提问于 2025-04-17 20:01

给定下面两个数据框:

>>> import pandas as pd

>>> df_a = pd.DataFrame([{"a": 1, "b": 4}, {"a": 2, "b": 5}, {"a": 3, "b": 6}])
>>> df_b = pd.DataFrame([{"c": 2, "d": 7}, {"c": 3, "d": 8}])
>>> df_a
   a  b
0  1  4
1  2  5
2  3  6

>>> df_b
   c  d
0  2  7
1  3  8

我们想要用一种不简单的条件来对这两个数据框进行类似SQL的连接,比如说“df_b.c > df_a.a”。从我所了解的情况来看,虽然merge()确实是解决方案的一部分,但我不能直接使用它,因为它不接受任意的“ON”条件(除非我漏掉了什么?)。

在SQL中,结果看起来是这样的:

# inner join
sqlite> select * from df_a join df_b on c > a;
1|4|2|7
1|4|3|8
2|5|3|8

# outer join
sqlite> select * from df_a left outer join df_b on c > a;
1|4|2|7
1|4|3|8
2|5|3|8
3|6||

我目前进行内连接的方法是先生成df_a和df_b的笛卡尔积,给两个数据框都加一列“1”,然后在“1”列上使用merge(),再应用“c > a”的条件。

>>> import numpy as np
>>> df_a['ones'] = np.ones(3)
>>> df_b['ones'] = np.ones(2)
>>> cartesian = pd.merge(df_a, df_b, left_on='ones', right_on='ones')
>>> cartesian
   a  b  ones  c  d
0  1  4     1  2  7
1  1  4     1  3  8
2  2  5     1  2  7
3  2  5     1  3  8
4  3  6     1  2  7
5  3  6     1  3  8
>>> cartesian[cartesian.c > cartesian.a]
   a  b  ones  c  d
0  1  4     1  2  7
1  1  4     1  3  8
3  2  5     1  3  8

对于外连接,我不太确定最佳的方法,目前我一直在尝试先进行内连接,然后应用条件的否定来获取其他所有行,再试着把这个“否定”集合编辑到原始数据中,但这并不太奏效。

编辑。HYRY在这里回答了具体问题,但我需要一些更通用的、符合Pandas API的东西,因为我的连接条件可以是任何东西,而不仅仅是那一个比较。对于外连接,首先我在“左”侧添加一个额外的索引,这样在进行内连接后它会保持不变:

df_a['_left_index'] = df_a.index

然后我们进行笛卡尔积,得到内连接:

cartesian = pd.merge(df_a, df_b, left_on='ones', right_on='ones')
innerjoin = cartesian[cartesian.c > cartesian.a]

接着我获取“df_a”中需要的额外索引ID,并从“df_a”中获取行:

remaining_left_ids = set(df_a['_left_index']).\
                    difference(innerjoin['_left_index'])
remaining = df_a.ix[remaining_left_ids]

然后我们使用简单的concat(),这会把缺失的列用“NaN”替代(我之前以为它不这样做,但看来确实是这样):

outerjoin = pd.concat([innerjoin, remaining]).reset_index()

HYRY的想法是只对我们需要比较的那些列进行笛卡尔积,这基本上是正确的答案,尽管在我具体的情况下实现起来可能有点棘手(因为要通用化)。

问题:

  1. 你会如何在“c > a”上生成df_1和df_2的“连接”?你会采用相同的“笛卡尔积,过滤”方法,还是有更好的方法?

  2. 你会如何生成相同的“左外连接”?

3 个回答

0

conditional_join 是来自pyjanitor的一个功能,它在处理非等值连接时表现得非常好:

# pip install pyjanitor
import pandas as pd
import janitor

内连接

 df_a.conditional_join(df_b, ('a', 'c', '<'))

  left    right
     a  b     c  d
0    1  4     2  7
1    1  4     3  8
2    2  5     3  8

左连接

df_a.conditional_join(df_b, ('a', 'c', '<'), how = 'left')

  left    right
     a  b     c    d
0    1  4   2.0  7.0
1    1  4   3.0  8.0
2    2  5   3.0  8.0
3    3  6   NaN  NaN

这个功能可以接收多个条件的参数,这些条件是以元组的形式传入的,包含了三个部分:左边的列右边的列连接操作符

1

这可以通过广播和np.where来实现。你可以使用任何一个返回真或假的二元运算符:

import operator as op

df_a = pd.DataFrame([{"a": 1, "b": 4}, {"a": 2, "b": 5}, {"a": 3, "b": 6}])
df_b = pd.DataFrame([{"c": 2, "d": 7}, {"c": 3, "d": 8}])

binOp   = op.lt
matches = np.where(binOp(df_a.a[:,None],df_b.c.values))

print pd.concat([df.ix[idxs].reset_index(drop=True) 
                 for df,idxs in zip([df_a,df_b],matches)],
                axis=1).to_csv()

,a,b,c,d

0,1,4,2,7

1,1,4,3,8

2,2,5,3,8

7

我使用了ufunc的外部方法来计算结果,这里有个例子:

首先,准备一些数据:

import pandas as pd
import numpy as np
df_a = pd.DataFrame([{"a": 1, "b": 4}, {"a": 2, "b": 5}, {"a": 3, "b": 6}, {"a": 4, "b": 8}, {"a": 1, "b": 7}])
df_b = pd.DataFrame([{"c": 2, "d": 7}, {"c": 3, "d": 8}, {"c": 2, "d": 10}])
print "df_a"
print df_a
print "df_b"
print df_b

输出结果:

df_a
   a  b
0  1  4
1  2  5
2  3  6
3  4  8
4  1  7
df_b
   c   d
0  2   7
1  3   8
2  2  10

这是内连接,因为这只计算了ca的笛卡尔积,所以内存使用量比整个数据表的笛卡尔积要少:

ia, ib = np.where(np.less.outer(df_a.a, df_b.c))
print pd.concat((df_a.take(ia).reset_index(drop=True), 
                 df_b.take(ib).reset_index(drop=True)), axis=1)

输出结果:

   a  b  c   d
0  1  4  2   7
1  1  4  3   8
2  1  4  2  10
3  2  5  3   8
4  1  7  2   7
5  1  7  3   8
6  1  7  2  10

要计算左外连接,可以使用numpy.setdiff1d()来找出所有在内连接中没有的df_a的行:

na = np.setdiff1d(np.arange(len(df_a)), ia)
nb = -1 * np.ones_like(na)
oa = np.concatenate((ia, na))
ob = np.concatenate((ib, nb))
print pd.concat([df_a.take(oa).reset_index(drop=True), 
                 df_b.take(ob).reset_index(drop=True)], axis=1)

输出结果:

   a  b   c   d
0  1  4   2   7
1  1  4   3   8
2  1  4   2  10
3  2  5   3   8
4  1  7   2   7
5  1  7   3   8
6  1  7   2  10
7  3  6 NaN NaN
8  4  8 NaN NaN

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