使用HDF5文件时，iPython报错'HDFStore需要PyTables

Question

我刚开始学习Python，想用pandas创建一个表格，使用HDFStore，代码如下：

store = HDFStore('store.h5')

但是我遇到了一个错误：

Exception                                 Traceback (most recent call last)
C:\Python27\<ipython-input-11-de3060b689e6> in <module>()
----> 1 store = HDFStore('store.h5')

C:\Python27\lib\site-packages\pandas-0.10.1-py2.7-win32.egg\pandas\io\pytables.pyc in __init__(self, path, mode, complevel, complib, fletcher32)
    196             import tables as _
    197         except ImportError:  # pragma: no cover
--> 198             raise Exception('HDFStore requires PyTables')
    199 
    200         self.path = path

Exception: HDFStore requires PyTables 

我已经安装了Pytables，并且它在site-packages文件夹里。我的pandas版本是0.10.1，pytables版本是2.4.0，都是32位的Windows版本。Python的版本是2.7.3，也是32位的Windows版本。

我是在ipython notebook上运行这个的。

我还忘了说，我的操作系统是64位的Windows 7，但Python和所有相关的插件都是32位的。

Answer 1

我之前也遇到过同样的问题。我使用的是win7系统，搭配anaconda的python2.7和IPython。

不过我通过以下步骤解决了这个问题：

首先，从这个链接 http://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/#pytables 下载文件 tables‑3.2.1‑cp27‑none‑win_amd64.whl。

然后用命令行(cmd)来安装这个文件。

pip install tables‑3.2.1‑cp27‑none‑win_amd64.whl

安装完成后，问题就解决了。

参考链接: http://www.pytables.org/usersguide/installation.html#binary-installation-windows

Answer 2

我怀疑你的问题是因为你没有把Python脚本添加到系统的 PATH 里。你可以参考这个教程，了解怎么做。

你需要添加 C:\Python27, C:\Python27\Lib. 和 C:\Python27\Scripts。记得用 ; 把每个路径分开。而且要确保你是把它添加到系统的 PATH 变量里，而不是仅仅用户的 PATH 变量。

完成这些之后，检查一下 import pytables。这时候应该不会再报错了，因为Python会“知道”pytables已经安装，并且能够找到它。

Answer 3

我在使用HDFStore的时候也遇到了同样的错误。我尝试了上面提到的所有步骤，花了很多小时去寻找解决办法，但都没有成功。

然后我下载并安装了MiniConda。接着我用下面的命令来安装pytables。

conda install -c conda-forge pytables

请参考下面的截图。