我使用cython的方法正确吗？
我最近在把一些Python的函数和类转换成Cython，目的是为了提高性能。现在我有了很多.pyx文件和对应的.py文件，它们的代码基本上是一样的，只不过Cython的版本里给变量加上了类型。不过，有时候Cython的代码会对Python的代码做一些小改动——（1）因为这样改动后的代码运行得更快，但功能上是等价的。
一开始我觉得代码重复没什么大问题。而且，我计划定期比较Python和Cython的输出，这样可以更快发现其中一个的意外修改。问题是，随着我发现bug、进行改进等，我需要花更多的时间来保持这两种实现的一致性。这让我开始怀疑这样使用Cython是否正确。
我知道理想情况下，应该先用Python完成整个项目，如果发现速度慢，再找出关键部分用Cython加速。然而，在我的项目中，我把Python当作Matlab的替代品，用来互动式地原型设计我正在开发的增强现实系统的算法。这个系统是实时运行的，所以我经常会提前用Cython来加速新算法，以提高帧率，看看它在实时情况下的表现。
所以我有几个问题：
涉及大量Cython代码的项目是否会有重复代码？也就是同时存在.pyx文件和对应的.py文件，并保持它们同步？还是说直接只用Cython，直接在Cython中开发新算法？这样就不会有重复代码了。不过，我在我最喜欢的Python IDE（wingIDE）中无法调试Cython代码。说到这一点，我在Windows 7上从来没能让cygdb正常工作（经过长时间的尝试，我觉得它只在Linux上能用），所以我只能通过打印语句来调试Cython代码，这样并不理想，基本上我失去了用Python和wingIDE进行互动式开发（像Matlab那样）的能力。
还有纯Python模式 http://docs.cython.org/src/tutorial/pure.html，我喜欢用.pxd文件来增强我的Python代码，这样就不会有重复代码的问题。我还没尝试过，但我读到了一些限制，所以不确定它是否足够好。此外，我不知道在纯Python模式下，是否能把我上面提到的（1）中的小改动整合进去。这些改动可以放在.pxd文件里吗？还是说我需要为这些修改再创建一个.pxy文件？或者干脆就不修改任何东西。有没有人对纯Python模式有好的经验？
我不知道是否有更好的使用Cython的方法，所以如果你知道更好的方法，请告诉我们。
1 个回答
简单来说，Python项目不会同时保留Cython和Python的代码，因为维护两个版本太麻烦了。
我使用Cython的方式是这样的：首先我会用Python写代码。通常我会在小数据集上测试，这样速度不是问题。如果我发现代码运行得太慢，我会尝试在Python中进行优化。如果找不到优化的方法，我就会尝试用Cython来改进代码。完成后，我会用ipython的%timeit功能比较Python和Cython版本的速度。
确实，Cython代码比Python代码更难调试。不过通常在我开始写Cython代码时，我的算法已经没有错误了。而且，当出现错误时，错误信息会告诉你是Cython代码的哪一行出了问题。如果你的代码崩溃了，可以尝试用gdb来调试它。
我还没有使用过pxd文件。