Numpy、Atlas和Lapack

Question

我正在使用numpy来进行一些数组操作，但现在速度非常慢。在matlab中做同样的操作（计算协方差矩阵）只需要一秒钟。我已经安装了atlas和lapack，但我不确定我的numpy是否真的在使用它们。有没有人知道怎么检查这个？我是在mac上使用的。

Answer 1

要让numpy使用ATLAS，你需要做以下两件事之一：

• 从源代码编译它，这样你就需要设置一个叫做site.cfg的文件，让它能找到你的ATLAS库。我今天大部分时间都在搞这个，终于在Gentoo上成功了（可以看看这个错误报告），不过我不太确定我的经验能否很好地适用于Mac。
• 找一个已经编译好的包，它可以使用ATLAS。你可以看看Anaconda或者Canopy，这些地方可能会有，不过它们的优化库可能只在付费版本里提供——我对此不太确定。