Networkx:可视化MultiGraph时重叠边缘
下面这个多重图的绘制效果是正确的(也就是说,平行的边不会重叠),是通过使用 graphviz 的 neato 来生成一个 png 图片(具体效果可以参考 这个回答)
import networkx as nx
nx.MultiGraph ([(1,2),(1,2),(1,2),(3,1),(3,2)])
nx.write_dot(Gm,'multi.dot')
!neato -T png multi.dot > multi.png
但是,使用 Networkx 的绘图函数就不行了
nx.draw_graphviz(Gm,prog='neato')
有没有办法通过 Networkx 的绘图方法来防止边重叠呢?
谢谢
4 个回答
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对上面答案的一个改进是给nx.draw添加一个叫做 connectionstyle 的参数:
import networkx as nx
G = nx.DiGraph()
G.add_nodes_from([0,1])
pos = nx.circular_layout(G)
nx.draw_networkx_nodes(G, pos, connectionstyle='arc3, rad = 0.1', node_color = 'r', node_size = 100, alpha = 1)
nx.draw_networkx_edges(G, pos,connectionstyle='arc3, rad = 0.1', edgelist = [(0,1)], width = 2, alpha = 0.5, edge_color='b')
nx.draw_networkx_edges(G, pos,connectionstyle='arc3, rad = 0.1', edgelist= [(1,0)], width = 1, alpha = 1)
plt.axis('off')
plt.show()
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很遗憾,目前还不行。虽然从技术上讲是有可能做到的,但到现在为止还没有人写出相关的代码。
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你可以直接使用你计算出来的节点位置来使用matplotlib这个库。
G=nx.MultiGraph ([(1,2),(1,2),(1,2),(3,1),(3,2)])
pos = nx.random_layout(G)
nx.draw_networkx_nodes(G, pos, node_color = 'r', node_size = 100, alpha = 1)
ax = plt.gca()
for e in G.edges:
ax.annotate("",
xy=pos[e[0]], xycoords='data',
xytext=pos[e[1]], textcoords='data',
arrowprops=dict(arrowstyle="->", color="0.5",
shrinkA=5, shrinkB=5,
patchA=None, patchB=None,
connectionstyle="arc3,rad=rrr".replace('rrr',str(0.3*e[2])
),
),
)
plt.axis('off')
plt.show()