使用Pandas Multiindex和数量时失败,显示“类别级别必须唯一”
在使用pandas的多重索引时,如果索引中包含单位,有时候会出现问题。让我给你举个例子:
import quantities as pq
import pandas as pd
i = np.arange(10) * pq.J
j = np.array([1 for _ in xrange(10)]) * pq.K
pd.MultiIndex.from_tuples(zip(i, j), names=['Energy', 'Temperature'])
这个例子会报错,错误信息如下:
---------------------------------------------------------------------------
ValueError Traceback (most recent call last)
<ipython-input-86-c2d09517b80e> in <module>()
5 j = np.array([1 for _ in xrange(10)]) * pq.K
6
----> 7 pd.MultiIndex.from_tuples(zip(i, j), names=['Energy', 'Temperature'])
C:\Python27\lib\site-packages\pandas\core\index.pyc in from_tuples(cls, tuples, sortorder, names)
1685
1686 return MultiIndex.from_arrays(arrays, sortorder=sortorder,
-> 1687 names=names)
1688
1689 @property
C:\Python27\lib\site-packages\pandas\core\index.pyc in from_arrays(cls, arrays, sortorder, names)
1646 return Index(arrays[0], name=name)
1647
-> 1648 cats = [Categorical.from_array(arr) for arr in arrays]
1649 levels = [c.levels for c in cats]
1650 labels = [c.labels for c in cats]
C:\Python27\lib\site-packages\pandas\core\categorical.pyc in from_array(cls, data)
59
60 return Categorical(labels, levels,
---> 61 name=getattr(data, 'name', None))
62
63 _levels = None
C:\Python27\lib\site-packages\pandas\core\categorical.pyc in __init__(self, labels, levels, name)
45 def __init__(self, labels, levels, name=None):
46 self.labels = labels
---> 47 self.levels = levels
48 self.name = name
49
C:\Python27\lib\site-packages\pandas\core\categorical.pyc in _set_levels(self, levels)
68 levels = _ensure_index(levels)
69 if not levels.is_unique:
---> 70 raise ValueError('Categorical levels must be unique')
71 self._levels = levels
72
ValueError: Categorical levels must be unique
如果我去掉单位,代码就能正常运行。
i = np.arange(10)
j = np.array([1 for _ in xrange(10)])
pd.MultiIndex.from_tuples(zip(i, j), names=['Energy', 'Temperature'])
如果我保留单位,但为j使用一个独特的项目,代码也能正常运行。
i = np.arange(10) * pq.J
j = np.arange(10) * pq.K
pd.MultiIndex.from_tuples(zip(i, j), names=['Energy', 'Temperature'])
不过,这样做并不可行,因为这些索引是来自测量数据的。我真的很想保留单位,但由于我对pandas的内部机制不太了解,所以不知道该怎么解决这个问题。
版本信息
我使用的是pandas版本0.10.1和quantities版本0.10.1,运行在python 2.7上。
1 个回答
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我能够重现这个错误,但它在Linux上是间歇性的,每隔几次调用pd.MultiIndex.from_tuples(...)
就会失败。
我认为这个错误是因为quantity
对象违反了Python的一个规则:如果a==b
成立,那么hash(a)==hash(b)
也应该成立。这个规则的详细信息可以参考这里:http://bugs.python.org/issue13707#msg150596和https://groups.google.com/forum/#!msg/sympy/pJ2jg2csKgU/0nn21xqZEmwJ。
这里有一个不好的哈希行为的例子。
In [5]: (1 * pq.K) == (1 * pq.K)
Out[5]: True
In [6]: hash(1 * pq.K) == hash(1 * pq.K)
Out[6]: False
根据这种行为,我认为这是一个关于数量对象的问题,这导致了pandas内部状态的不合法。
在我看来,最好的解决办法是让数量对象返回一个基于当前值的一致哈希,就像这个(被拒绝的)请求,想要在数量对象上添加一个__hash__()
函数:https://github.com/python-quantities/python-quantities/pull/29。
要么这样,要么在尝试哈希时抛出一个错误,如果它想表现得像一个可变对象。