Subprocess.call或Subprocess.Popen无法使用PATH中的可执行文件（Linux/Windows）

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提问于 2025-04-17 14:39

我正在写一个程序，需要在Linux和Windows上都能运行，并且要使用在路径中存在的可执行文件（假设是这样）。

目前我在Windows上使用Subprocess.Call和Subprocess.Popen运行可执行文件时遇到了问题。

像这样的代码，在Windows 8上：

def makeBlastDB(inFile, inputType, dbType, title, outDir):
    strProg = 'makeblastdb'
    strInput = '-in ' + inFile
    strInputType = '-input_type ' + inputType
    strDBType = '-dbtype ' + dbType
    strTitle = '-title ' + title
    strOut = '-out ' + os.path.join(os.sep, outDir, title)
    cmd = [strProg, strInput, strInputType, strDBType, strTitle, strOut]
    result = Popen(cmd, shell=True)

我在控制台中收到了错误信息：

'makeblastdb' is not recognized as an internal or external command,
operable program or batch file.

尽管我可以通过cmd.exe运行相同的命令，但即使设置shell=False，我也得到了相同的反馈。

有没有什么办法可以运行这个命令，假设可执行文件在PATH环境变量中？谢谢！

Linux windows subprocess error handling command-line executable files cross-platform compatibility path environment variable

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我自己也为这个问题苦恼过，直到我发现了这个Python的错误报告。

报告中提到：“如果你在Windows上把一个目录添加到PATH里，并且这个目录是用引号括起来的，subprocess就找不到里面的可执行文件。”因为Windows并不需要引号，所以去掉引号就解决了我的问题（在2.7版本中）。

回答于 2025-04-17 由 Python大师

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你可以通过传递一个包含环境变量的映射，来控制新创建的子进程中可用的环境变量，这个映射是通过env这个参数来实现的。例如：

proc = subprocess.Popen(args, env={'PATH': '/some/path'})

或者，如果你只想从系统环境中继承PATH这个变量，而不想把其他的系统环境变量都带上，可以这样做：

proc = subprocess.Popen(args, env={'PATH': os.getenv('PATH')})

不过，直接使用绝对路径可能会更简单一些。

回答于 2025-04-17 由 Python大师

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好的，下面是我让它工作的方式。

env = os.environ
proc = subprocess.Popen(args, env=env)

回答于 2025-04-17 由 Python大师

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Subprocess.call或Subprocess.Popen无法使用PATH中的可执行文件（Linux/Windows）

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