matplotlib的savefig是线程安全的吗?
我有一个内部使用的分布式计算库,我们经常用它来进行并行计算。在处理过程中,数据会被分成不同的部分,然后每个部分会加载数据、进行计算,最后会有一个“保存”的步骤。通常,这个步骤是把数据写入数据库表中。
不过,对于一个特定的任务,我需要每个处理的输出是一个包含数据图表的 .png 文件。总共有 95 个处理,所以我需要 95 个 .png 文件。
在我的“保存”步骤中(每个处理都会执行这个步骤),我有一些非常简单的代码,它使用 matplotlib 的 boxplot
函数来制作箱线图,并且用 savefig
函数把图保存为一个 .png 文件,文件名是根据该处理使用的特定数据生成的独特名称。
然而,我偶尔会看到输出结果,似乎有两个或多个数据集被写入了同一个输出文件,尽管它们的名字是独特的。
matplotlib 在制作箱线图或保存图形时是否使用临时文件保存?如果是的话,它是否总是使用相同的临时文件名(这样就可能导致覆盖冲突)?我用 strace
运行了我的处理,但没有看到明显的来自 matplotlib 的临时文件写入。
我该如何确保这个过程是线程安全的?我确实希望能够并行进行文件保存,因为我想大幅增加输出的 .png 文件数量,所以先存储所有数据再逐个执行绘图/保存的方式是非常不理想的。
我无法重现我们使用的完整并行基础设施,但下面是用于创建图形句柄的函数,以及用于保存图形的函数。为了问题的讨论,你可以假设线程安全与我们的分布式库无关。我们知道问题不在我们的代码上,因为我们的代码已经使用多年进行多进程工作,没有出现过这样的线程问题(尤其是对于我们无法直接控制的东西,比如 matplotlib 的临时文件)。
import pandas
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
def plot_category_data(betas, category_name):
"""
Function to organize beta data by date into vectors and pass to box plot
code for producing a single chart of multi-period box plots.
"""
beta_vector_list = []
yms = np.sort(betas.yearmonth.unique())
for ym in yms:
beta_vector_list.append(betas[betas.yearmonth==ym].Beta.values.flatten().tolist())
###
plot_output = plt.boxplot(beta_vector_list)
axs = plt.gcf().gca()
axs.set_xticklabels(betas.FactorDate.unique(), rotation=40, horizontalalignment='right')
axs.set_xlabel("Date")
axs.set_ylabel("Beta")
axs.set_title("%s Beta to BMI Global"%(category_name))
axs.set_ylim((-1.0, 3.0))
return plot_output
### End plot_category_data
def save(self):
"""
Make calls to store the plot to the desired output file.
"""
out_file = self.output_path + "%s.png"%(self.category_name)
fig = plt.gcf()
fig.set_figheight(6.5)
fig.set_figwidth(10)
fig.savefig(out_file, bbox_inches='tight', dpi=150)
print "Finished and stored output file %s"%(out_file)
return None
### End save
1 个回答
在你的两个函数里,你都在用 plt.gcf()
。我建议你每次绘图的时候都用 plt.figure()
来生成一个新的图形,并且明确地引用这个新的图形,这样就能完全避免这个问题了。