将DICOM转换为TIFF

Question

我刚开始学Python，所以如果我说的不对，请多包涵。我想在一个文件夹里查找所有的DICOM文件，并把它们转换成TIFF文件。我已经搞定了搜索功能，但在保存图片为TIFF格式时遇到了困难。我正在使用pydicom库来读取DICOM文件并处理一些头部信息。另外，我试过用pydicom里的save_as函数来保存为TIFF，但我更想用PIL里的save函数，这样可以更好地设置TIFF的压缩方式。我觉得问题在于我不知道怎么提取DICOM文件里的实际图像数据，并把它放到一个新的图像里。任何帮助都非常感谢... 谢谢！

Python 2.7
PIL 1.1.7
Pydicom 0.9.6

Answer 1

之前在网上找到过一个类似的问题的答案，虽然我不记得具体是哪个网站，但我把这个方法应用到我的代码里了，所以在这里分享给大家：

 import pylab
 import dicom
 ImageFile=dicom.read_file(<SourceFilePath>) #Path to "*.dcm" file
 pylab.imshow(ImageFile.pixel_array,cmap=pylab.cm.bone) #to view image

如果你想保存图片，可以用下面的代码： pylab.imsave('<目标文件路径>', ImageFile.pixel_array, cmap=pylab.cm.bone)

这里的 imsave 默认会把图片保存为 .png 格式。不过，如果你想要其他格式，也可以在 imsave() 里指定，只要那个格式是支持的。

希望这个对你有帮助。

Answer 2

如果你知道怎么用 PIL 来保存图片数据为 .tiff 格式，那么这个例子可以帮助你把图片数据从 pydicom 传递到 PIL（在评论中还有更多的信息）。