寻找可视化多维数据的库/工具
我正在使用Python来分析一大堆实际测量的数据。简单来说，我有两个函数，它们会对这些数据进行转换，并且每个函数都需要三个“计数”参数，最后会返回一系列浮点数。我希望在选择合适的参数时，能看到一些有趣的模式出现。我预期这些模式可能会在每个函数返回的序列之间有关系，或者与参数本身的某些模式有关。如果有帮助的话，这三个“计数”参数大致对应于：
- 一个“窗口大小”，用于计算基础数据的总结统计信息
- 用于计算单个总结统计信息的连续窗口数量（也就是说，在空间精度和时间精度之间的权衡）
- 一个“最小年龄”——这是对基础数据历史的一个偏移量。
这些总结统计信息（会为每个参数配置生成浮点数序列）并不简单，但会对这三个参数都很敏感。
我对可视化技术很感兴趣，希望能找到适合快速探索的工具，帮助我实验这些多维数据。
到目前为止，我尝试过MatPlotLib，但发现只能生成两维或三维的图表，这种批处理的方式让调查变得非常乏味。理想情况下，我希望能找到一个工具，能够可视化超过两个维度……也许可以在一个互动的界面中实时切换不同的维度。
如果有可视化方面的高手能给我一些建议，告诉我应该研究哪些合适的工具，那将非常感谢——最好是能与我现有的Python函数集成，或者是其他语言的工具。我特别想听听大家在类似可视化问题上成功的经验。
补充说明: 我正在考虑的一种可能方法是使用动画在2D或3D图上展示（以捕捉另一个维度……留出1或2个维度供手动选择）……不过到目前为止，我还没有找到好的工具来实现这一点。
8 个回答
如果你只想要一个动画效果的表面，那么gnuplot可以做到这一点。你可以在这里找到一个简单的介绍 ，或者在gnuplot的常见问题解答中找到相关信息。更详细的内容可以在gnuplot的文档中找到。
你可能想看看如何输出带动画的SVG图形，如果是这样的话，这个问题可能会对你有帮助。我觉得制作动画可能需要你花费很多精力。还有一个选择是把数据可视化成图表，不过我对你的数据了解不够，不确定这样做对你是否有用。如果有用的话，cytoscape是可以用Python脚本来操作的。
RGL 是一个用于 R 语言的可视化设备系统，它使用 OpenGL 来进行图形渲染。简单来说，RGL 的核心是一个用 C++ 写的实时 3D 引擎。它提供了一种互动的视角导航功能（支持鼠标和滚轮），同时也有 R 语言的编程接口。
GGobi 是一个开源的可视化程序，用来探索高维数据。它提供了非常动态和互动的图形，比如数据游览，同时也有一些常见的图形，比如散点图、条形图和并行坐标图。这些图形都是互动的，可以通过刷选和识别来进行联动。
这里有一个教程，涵盖了上述两个系统的内容，点击这里可以查看。
RPy 是一个非常简单但功能强大的 Python 接口，可以与 R 编程语言进行交互。它可以管理各种 R 对象，并且可以执行任意的 R 函数（包括图形相关的函数）。R 语言中的所有错误都会转换成 Python 的异常。任何为 R 系统安装的模块都可以在 Python 中使用。