如何用Python将嵌入的Neo4j图数据库转换为GraphML？

Question

我想把我嵌入的Neo4j图数据库存储为GraphML格式，这样我就可以用像yEd这样的工具来绘制它。

我正在用python27来管理这个图数据库。

有没有人知道怎么做到这一点？

Answer 1

如果neo4j.py不支持导出为GraphML格式，或者因为其他原因你无法使用Neo4j和Java做到这一点，那么你就需要自己写一个导出工具。

通过一些简单的技巧，你可以使用NetworkX来实现，因为它支持从GraphML导入和导出。你只需要找到一种方法，把你的Neo4j图导入到NetworkX中，然后直接导出为GraphML格式。

Answer 2

如果你能在不影响当前工作的情况下进行操作，也就是说你需要先关闭正在使用嵌入式数据库的程序，然后等导出完成后再重新启动它，你可以使用Gremlin来完成这个任务。以下是你需要用到的命令：

g = new Neo4jGraph("/YOUR/GRAPH/DIRECTORY")
writer = new GraphMLWriter(g)
out = new FileOutputStream("/YOUR/GRAPHML/file.graphml")
writer.outputGraph(out)
writer.setNormalize(true)
out.close()

这样做会生成一个漂亮的graphml文件，适合导入到像Gephi或Cytoscape这样的工具中进行查看。

如果你需要在程序运行时导出图形，你就需要用到像jython这样的工具来运行你的python脚本，然后通过导入com.tinkerpop.blueprints中的对象来使用上面的命令。