编译和安装Cantera Python模块时遇到问题

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提问于 2025-04-17 06:32

我正在尝试在Ubuntu Linux上安装Cantera这个Python模块。为了参考，我使用了这些说明：安装Cantera。在运行了./preconfig和make之后，我遇到了以下错误：

fatal error: numarray/arrayobject.h: No such file or directory

根据preconfig文件，

# If numpy was installed using the --home option, set this to the
# home directory for numpy. This will be needed for all numpy installations
# that don't put the include files into python's native include directory.
#NUMPY_HOME=${NUMPY_HOME:="$HOME/python_packages"}

我使用的是Enthought Python Distribution的学生版本，所以我想也许我需要把最后一行改成：

NUMPY_HOME=${NUMPY_HOME:="/usr/local/EPD/lib/python2.7/site-packages/"}

但这样还是不行。我仍然遇到同样的错误。有什么想法吗？我已经安装了python-dev来修复之前的一个错误，所以这不是问题所在。

安装 Linux 编译 ubuntu 依赖管理错误调试 cantera Enthought

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我们之前尝试过只在预配置中设置包含变量，但从来没有成功过。相反，我们是这样做的：

...
USE_NUMPY=${USE_NUMPY:="y"}

if [ "$USE_NUMPY" = "y" ]; then
    export NUMPY_INC_DIR=`python -c 'import numpy; print numpy.get_include()'`
fi

自从我们开始这样包含之后，就没有遇到过任何问题。

回答于 2025-04-17 由 Python大师

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你可能在你的Ubuntu系统上安装了多个Python版本。为了使用EPD来安装Cantera，你需要明确告诉它要使用哪个版本：

PYTHON_CMD=${PYTHON_CMD:="/usr/local/EPD/bin/python"}

每个版本都有自己的site-packages目录，所以通过指定PYTHON_CMD，你也就指定了要使用哪个site-packages。当Numpy安装时，它还会在site-packages/numpy/core/include/numpy目录下安装与Numarray的接口，因此不需要单独下载Numarray。另外，numpy会被安装到EPD的site-packages目录中，所以NUMPY_HOME（这个变量只有在numpy没有安装在默认目录时才会用到）可以保持不变。希望这些信息对你有帮助。

回答于 2025-04-17 由 Python大师

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我找到了解决办法。按照我之前遵循的这些说明，我成功了。上次我下载的是tar.gz文件，这次我用了子版本库，可能更新得更及时吧。总之，这次成功了，而且我也不需要更改默认的python命令。

补充一下：我确实需要把这个从默认值改成：

PYTHON_CMD=${PYTHON_CMD:="/usr/local/EPD/bin/python"}

我觉得把这些步骤也发出来，方便其他用户参考，是个好主意：

第一步是安装一些依赖项。这可以通过apt-get来处理： sudo apt-get install subversion g++ gfortran python2.6-dev python-numpy libsundials* graphviz
下一步是获取cantera的源代码。可以通过从cantera网站下载cantera-1.8.0-beta-tar.gz，或者从svn检查最新版本来完成： svn checkout http://cantera.googlecode.com/svn/cantera18/trunk/ cantera
进入cantera目录（无论是svn检出的还是解压后的cantera-1.8.0）
编辑名为preconfig的文件，确保以下几行被包含，可以通过注释或编辑来实现：
PYTHON_PACKAGE=${PYTHON_PACKAGE:="full"}
USE_NUMPY=${USE_NUMPY:="y"}
SUNDIALS_VERSION=${SUNDIALS_VERSION:='2.3'}

Then in a terminal run the following commands:
./preconfig
make
sudo make install
source ~/setup_cantera
If every thing went well you should be able to import the Cantera module in python:
python
>>>from Cantera import *

回答于 2025-04-17 由 Python大师

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