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在Qt4上安装MayaVi导致段错误

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提问于 2025-04-17 04:03

我正在尝试在我的电脑上安装MayaVi。我用的是一台MacBook Air，操作系统是OS X 10.6.8，内存4GB。

我的Python和大部分软件包都是通过Homebrew或pip安装的。特别是Python 2.7、ipython、Qt4、numpy、scipy、vtk等都是这样安装的。VTK是通过Homebrew安装的，使用了--python和--qt-extern的选项，所有的安装都没问题。我没有安装wxPython，因为我尝试通过pip、手动构建或者使用二进制文件都没成功。

如果我运行ipython -q4thread，就无法成功执行from mayavi import mlab，因为我遇到了一个错误，跟使用了两个不同的PyQt API有关：http://groups.google.com/group/spyderlib/browse_thread/thread/36a35baec74ca144

不过，如果我单独运行ipython，就能成功执行from mayavi import mlab。然后我尝试跟着这个例子走：http://github.enthought.com/mayavi/mayavi/example_using_with_scipy.html，里面有这些命令：

import numpy as np

def V(x, y, z):
    """ A 3D sinusoidal lattice with a parabolic confinement. """
    return np.cos(10*x) + np.cos(10*y) + np.cos(10*z) + 2*(x**2 + y**2 + z**2)

X, Y, Z = np.mgrid[-2:2:100j, -2:2:100j, -2:2:100j]

from mayavi import mlab
mlab.contour3d(X, Y, Z, V)

这一切都运行得很好，我看到一个窗口弹出来，可以旋转3D图形等等。但是，当我点击打开管道的图标时，又弹出了另一个窗口。教程接着说要双击“等值面”来改变它的属性。结果一双击，我就遇到了一个可重复的段错误。

我完全不知道该从哪里开始找出问题所在。

另外，我可以通过命令行运行MayaVi：mayavi2，然后GUI就会弹出来。当我这样做时，得到以下输出：

Warning: Unable to import the wx backend for pyface due to traceback: Traceback (most recent call last):
      File "/usr/local/Cellar/python/2.7.1/lib/python2.7/site-packages/pyface/toolkit.py", line 45, in _init_toolkit
        be = import_toolkit(tk)
      File "/usr/local/Cellar/python/2.7.1/lib/python2.7/site-packages/pyface/toolkit.py", line 31, in import_toolkit
        __import__(be + 'init')
      File "/usr/local/Cellar/python/2.7.1/lib/python2.7/site-packages/pyface/ui/wx/init.py", line 14, in <module>
        import wx
    ImportError: No module named wx

虽然GUI确实弹出来了，但如果我尝试进行任何操作，就会出现段错误。

如果你有任何关于如何排查这个问题的想法，或者关于如何成功重新安装这个软件包的建议，请告诉我。

谢谢！

Uri

numpy scipy pyqt macos mayavi qt4 vtk segmentation fault

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1

我也有一台运行OS X 10.7.4（狮子系统）的MacBook Air。去年二月份我花了很多时间让mayavi这个工具正常工作，最终成功地生成了一些科学图表。不过，这并不意味着所有的示例和测试都能正常运行，界面也会在控制台里显示很多错误信息，但大多数时候并不会崩溃。现在，我的Python安装坏掉了（可能是因为升级了numpy），所以我需要重新安装。可惜的是，六个月后情况并没有变得更简单！

目前仍然没有合适的预编译版本。我试过从这里下载Enthought Python Distribution：http://www.enthought.com/repo/.epd_academic_installers。但是Mac上仍然没有64位的版本，里面的组件都很老旧，基于wxPython的mayavi看起来很丑，而且反应慢。于是我又回到了brew和pip。经过很多次的尝试和错误，以下是我找到的比较有效的方法：

1. 前提条件

先隐藏或卸载坏掉的Homebrew Python安装：

mv /usr/local/lib/python2.7/site-packages /usr/local/lib/python2.7/site-packages-old 
mv /usr/local/share/python /usr/local/share/python-old
brew uninstall python pyqt pyside vtk

在Xcode（4.4.1）中，选择llvm-gcc作为编译器（我用clang的效果不太好）：

cd /usr/bin
sudo rm cc c++
sudo ln -s gcc cc
sudo ln -s g++ c++

2. 安装

2.1 Python

brew install python --framework --universal

指向新的安装位置：

cd /System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions
rm Current
ln -s /usr/local/Cellar/python/2.7.3/Frameworks/Python.framework/Versions/Current .

如果EPD已经安装，还需要在/Library/Frameworks/Python.framework/Versions中做同样的操作，否则EPD会优先使用。

2.2 Numpy

从源代码安装numpy（目前pip 1.2无法正确安装npymath.ini，这会导致scipy无法构建）：

git clone https://github.com/numpy/numpy.git
cd numpy
git checkout v1.6.2
python setup.py install

因为很多包都依赖于numpy，所以我强烈建议查看官方发布的版本，今天的版本是1.6.2。接下来，让numpy的头文件可见：

cd /usr/local/Cellar/python/2.7.3/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/include/python2.7
ln -s /usr/local/lib/python2.7/site-packages/numpy/core/include/numpy .

2.3 qt, pyqt, vtk

安装qt（4.8.2）和pyqt（4.9.4）：

brew install qt
brew install pyqt

你也可以安装pyside（1.1.1），

brew install pyside

但这似乎会导致mayavi崩溃更多。无论如何，添加

export QT_API=pyqt

到.bashrc中，以避免混淆。接下来安装vtk（5.10.0；5.8.0也可以正常工作）

brew install vtk --python --tcl --examples --qt

...然后等着（编译大约需要40分钟）。--qt这个选项不是绝对必要的，但加上也没坏处。

接下来，从http://www.vtk.org/files/release/5.10/vtkdata-5.10.0.tar.gz下载vtk数据，解压到某个地方，并让VTK_DATA_ROOT环境变量指向VTKData目录。在

/usr/local/share/vtk/Examples

中运行一些示例，使用python <example>.py启动python示例，使用vtk <example.tcl>启动TCL示例。效果非常好，对吧？接下来看看mayavi是怎么搞砸这一切的...

2.4 ETS和mayavi

虽然

pip install mayavi

能让你走得更远，但它似乎比从github安装最新版本更容易崩溃。获取https://github.com/enthought/ets/raw/master/ets.py并运行

python ets.py clone

来克隆ETS的git仓库。你只需要apptools、mayavi、pyface、traits和traitsui，如果你想从命令行运行mayavi2，可能还需要envisage。所以删除其他目录，然后执行

python ets.py develop

这应该能让你在mayavi/examples/tvtk和mayavi/examples/mayavi中运行一些示例，使用python <example>.py并玩玩界面。虽然会有很多控制台错误和一些界面功能无法使用，比如选择LUT表，但希望不会崩溃。

2.5 scipy, matplotlib, ipython

我更喜欢从github获取最新版本的scipy和matplotlib。首先使用brew安装所有依赖项。然后

git clone https://github.com/scipy/scipy.git
cd scipy
python setup.py install

git clone https://github.com/matplotlib/matplotlib.git
cd matplotlib
python setup.py install

接着使用pip安装ipython（0.13）。对于qtconsole，先安装：

pip install pygments
pip install pyzmq

然后

pip install ipython

有几种可能的方式来启动ipython以便与mayavi一起使用，这取决于谁控制QT事件循环：

  • ipython不带mlab.show()：会卡住。
  • ipython带mlab.show()：可以工作，但提示符可能会变得无响应。
  • ipython --gui=qt或ipython --pylab=qt：可以工作，但“保存”对话框会立即关闭。
  • ipython qtconsole不带mlab.show()：会卡住。
  • ipython qtconsole带mlab.show()：可以工作。
  • ipython qtconsole --gui=qt或ipython qtconsole --pylab=qt：可以工作。

祝你好运！

回答于 2025-04-17 由 Python大师
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