SQLite与Python...速度与激情

Question

我用Python写了一个程序，这个程序可以从蛋白质的fasta文件中建立一个数据库。fasta文件其实就是一个文本文件，里面包含了一些大分子的序列。想了解更多内容，可以点击这里。

我的程序会从每个蛋白质生成一份肽链的列表，肽链就是蛋白质的片段。为了实现我的目标，程序会在SQLite中建立和查询一个数据库。

你知道有没有什么技巧可以让我的Python程序在填充或查询SQLite数据库时更快吗？如果我使用像SQLAlchemy这样的层或者ORM，能否提高性能呢？

Answer 1

使用ORM（对象关系映射）层不会提高性能，因为它会增加一些额外的负担。不过，你可能会发现实验起来更简单。考虑到你的数据量，你可以尝试在内存中创建数据库，这样会更快。或者，你也可以考虑使用其他类型的数据库，比如Redis。