制作一个包含三个Python代码的单一脚本

Question

我有三个Python代码，我想让它们一个接一个自动运行，这样最终只需要一次调用就能得到结果。请问我该如何把这些代码放到一个脚本里呢？这三个代码分别是 model-multiple.py、align2d.py 和 model-single.py。

其中 model-multiple.py 的内容是：

from modeller import *              # Load standard Modeller classes
from modeller.automodel import *    # Load the automodel class

log.verbose()    # request verbose output
env = environ()  # create a new MODELLER environment to build this model in


env.io.atom_files_directory = ['.', '../atom_files']

a = automodel(env,
alnfile  = '3NTD_align.ali', # alignment filename
knowns   = ('3NTDA'),    
sequence = 'target',        # code of the target
assess_methods=(assess.DOPE, assess.GA341,assess.normalized_dope))
a.starting_model= 1                 # index of the first model
a.ending_model  = 1              # index of the last model
                                    # (determines how many models to calculate)
a.make()                            # do the actual homology modeling

Answer 1

你可能需要考虑一下如何整理你的脚本，这样既方便从其他脚本调用，也能直接运行。一般的做法是：

def main():
    # do all the work
if __name__ = '__main__':
    import sys
    sys.exit(main())

Answer 2

如果这三个脚本和你的例子差不多，你可以用下面这个Python脚本一个接一个地运行它们：

__import__('model-multiple')
import align2d
__import__('model-single')

__import__ 是必须的，因为在导入名称中，连字符（-）是不允许的。如果你愿意重命名这些脚本：

import model_multiple
import align2d
import model_single

Answer 3

你有两个选择：

1. 快速简单的方法：在一个shell脚本或者Python脚本中，把它们一个接一个地调用（可以用system或者subprocess.Popen）
2. 把它们的工作放在一个函数里，然后把它们导入到一个脚本中，依次调用每个模块的“做工作”函数