在Python中将Z分数转换为p值
怎么把一个Z分数从Z分布(标准正态分布,高斯分布)转换成一个p值呢?我还没找到在Scipy的stats
模块里能做到这一点的神奇函数,但应该是有的。
7 个回答
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太好了!我找到了:scipy.special.ndtr
!这个函数似乎也可以在scipy.stats.stats.zprob
下面找到(其实它只是指向ndtr
的一个指针)。
具体来说,给定一个一维的numpy.array
实例z_scores
,我们可以这样得到p值:
p_values = 1 - scipy.special.ndtr(z_scores)
或者可以用另一种方式:
p_values = scipy.special.ndtr(-z_scores)
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我认为累积分布函数(cdf)比生存函数更好用。生存函数可以理解为1减去cdf,它可能会错误地传达语言模型在处理方向性百分位数时所用的假设。而且,百分位点函数(ppf)是cdf的反向函数,这样用起来非常方便。
>>> import scipy.stats as st
>>> st.norm.ppf(.95)
1.6448536269514722
>>> st.norm.cdf(1.64)
0.94949741652589625
编辑:有用户请求一个关于“向量”的例子:
import numpy as np
vector = np.array([.925, .95, .975, .99])
p_values = [st.norm.ppf(v) for v in vector]
f_values = [st.norm.cdf(p) for p in p_values]
for p,f in zip(p_values, f_values):
print(f'p: {p}, \tf: {f}')
结果:
p: 1.4395314709384563, f: 0.925
p: 1.6448536269514722, f: 0.95
p: 1.959963984540054, f: 0.975
p: 2.3263478740408408, f: 0.99
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我更喜欢正态分布的生存函数(上尾概率),因为这个函数的名字更能说明问题:
p_values = scipy.stats.norm.sf(abs(z_scores)) #one-sided
p_values = scipy.stats.norm.sf(abs(z_scores))*2 #twosided
正态分布“norm”是scipy.stats中大约90种分布之一。
norm.sf这个函数也会调用scipy.special中的相应函数,就像gotgenes的例子一样。
生存函数(sf)有一个小优势:在处理接近1的分位数时,它的数值精度应该比使用累积分布函数(cdf)要好。