Python和Rpy2：调用带有“.”选项的绘图函数

Question

我刚开始学习如何在 Python 中使用 rpy2。现在我能做一些简单的图表，但遇到了一个问题，就是很多 R 的选项里用到了“.”这个符号。比如，下面这个 R 的调用是可以正常工作的：

barplot(t, col=heat.colors(2), names.arg=c("pwn", "pwn2"))

这里的 t 是一个矩阵。

我想在 Python 中用同样的调用，但它不接受 names.arg 中的“.”部分。我原本以为在 Python 中可以把“.”替换成“_”，比如改成 names_arg，但这样也不行。我知道这个问题很基础，希望有人见过这个问题并能告诉我解决办法。谢谢！

Answer 1

在使用 rpy2-2.1.0 的时候，有一种写法是这样的：

from rpy2.robjects.packages import importr
graphics = importr("graphics")
grdevices = importr("grDevices")

graphics.barplot_default(t, 
                         col = grdevices.heat_colors(2),
                         names_arg = StrVector(("pwn", "pwn2")))

之所以需要用 barplot_default 而不是 barplot，是因为 R 语言的函数定义中经常使用省略号 '...'，而且要把参数名称进行翻译，就需要分析函数内部的 R 代码。

此外，还有一个示例函数可以帮助你把 '.' 转换成 '_'，你可以在这里找到更多信息： http://rpy.sourceforge.net/rpy2/doc-2.1/html/robjects.html#functions

Answer 2

我不确定Rpy是否会接受这个，不过你可以使用带有点的关键字参数。不过，你需要通过一个字典来传递它们。就像这样：

>>> def f(**kwds): print kwds
... 
>>> f(a=5, b_c=6)
{'a': 5, 'b_c': 6}
>>> f(a=5, b.c=6)
Traceback (  File "<interactive input>", line 1
SyntaxError: keyword cant be an expression (<interactive input>, line 1)
>>> f(**{'a': 5, 'b.c': 6})
{'a': 5, 'b.c': 6}

Answer 3

在这里，你可以使用字典来传递命名参数（通过使用 **），就像文档中描述的那样，直接调用R的函数。同时要记住，RPy2需要使用它自己的向量对象。是的，这样做有点麻烦，但好处是，你在rpy2中可以做任何在R中能做的事情。

from rpy2 import robjects
color = robjects.r("heat.colors")()
names = robjects.StrVector(("pwn", "pwn2"))
robjects.r.barplot(t, col=color, **{"names.arg":names})

（注意，这适用于rpy2版本2.0.x；在未发布的2.1版本中有一些变化，我还没有机会去了解。）