从HDF5文件中删除数据集属性

Question

我有一个hdf5文件，我想通过删除其中一个数据集的属性来修改它，然后保存这个文件，不做其他更改。我可以在hdfview中做到这一点，但我需要一个可以编写脚本的方式，因为我需要对很多文件进行这个操作。

我尝试用Python写了一个脚本，使用了h5py库：

import h5py
inF = h5py.File("Filename.h5", 'r')
dSet = inF['/data/myDataset']
del dSet.attrs['myAttrName']

但是我遇到了以下错误：

错误追踪（最近的调用在前）： 文件 "", 第 1 行, 在 文件 "/usr/lib/python2.7/dist-packages/h5py/_hl/attrs.py", 第 75 行, 在 delitem h5a.delete(self._id, self._e(name)) 文件 "h5a.pyx", 第 135 行, 在 h5py.h5a.delete (h5py/h5a.c:2682) KeyError: "无法删除属性（属性：无法删除消息）"

print dSet.attrs['myAttrName'] 这个命令能正确输出值，证明我可以访问这个属性。

还有其他方法可以做到这一点吗？也许可以使用h5repack？

Answer 1

你遇到的问题是因为你用只读模式打开了文件（"r"）。你需要用追加模式打开文件，像这样：

inF = h5py.File("Filename.h5", 'a')

Answer 2

我最后用了一个叫做h5copy的工具，属于hdf工具的一种：

h5copy -p -i inputFile.h5 -o outputFile.h5 -s /inputDataSetName -d /outputDataSetName -f noattr

因为我需要处理的所有文件都有相同的数据集，而且数据集的数量也不多，所以我写了一个shell脚本，让它对每个文件都调用一次h5copy。

需要注意的是，运行h5copy在一个组上，并不会删除该组中所有数据集的属性。