如何在关闭文件后保持h5py组在内存中？

Question

我该如何在关闭文件后保持h5py组在内存中？

在运行以下代码之后：

import h5py

feature_file = h5py.File(worm_file_path, 'r')
worm_features = feature_file["worm"]

我可以访问 worm_features，因为它是一个 h5py组（<HDF5 group "/worm" (4 members)>）

但是在我执行这一行之后：

feature_file.close()

我就无法再访问 worm_features 了。它现在显示为 <Closed HDF5 group>。

因为我需要加载大约20个文件中的worm_features h5py组，所以我想在处理我已经加载到内存中的数据之前关闭这些文件。这难道不可能吗？

Answer 1

使用 [:] 可以把数据集的值复制到一个变量中，这样在关闭 hdf5 文件后你仍然可以访问这个数据集。

import h5py

feature_file = h5py.File(worm_file_path, 'r')
worm_features = feature_file["worm"] [:]
feature_file.close()
print (worm_features)

.value 对我来说不管用，还报了以下错误：

AttributeError: 'Dataset' object has no attribute 'value'

Answer 2

使用 .value 来从数据集中提取你想要的变量。

举个例子：

import h5py

feature_file = h5py.File(worm_file_path, 'r')
worm_features = feature_file["worm"].value
feature_file.close()
print worm_features