Python单元测试与导入错误

Question

我发现了很多类似的帖子，但那些帖子没有解决我的问题。所以我想问一下关于我问题的情况。我的问题出在单元测试和模块导入上。我的项目结构如下。

app/
   __init__.py
   src/
       __init__.py
       person.py
   tests/
       __init__.py
       test_person.py 

我使用pytest来进行单元测试。在tests/test_person.py文件里。

## tests/test_person.py
from ..src import person

在src/person.py文件里。

## src/person.py
from Bio import PDB

我从app/目录运行py.test，结果出现了错误。

from Bio import PDB
E   ImportError: No module named Bio

我进一步在命令行测试，检查从Bio导入PDB是否能成功导入，结果没有任何错误，可以成功导入。

Python 2.7.4 (default, May 14 2013, 09:41:12) 
[GCC 4.4.6 20120305 (Red Hat 4.4.6-4)] on linux2
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>> from Bio import PDB
>>> 

我不知道错误出在哪里。有人能猜到吗？

Answer 1

在运行Python时，确保你当前的工作目录是应用程序的目录，否则from Bio import PDB可能会因为其他原因而成功。你可以使用os.chdir命令切换到app目录，然后再尝试导入，看它是否还能正常工作。

另外，Bio这个库到底在哪里呢？

编辑：根据你的评论，问题是因为使用了不同版本的Python。
要查看你正在使用哪个版本，可以简单地运行print sys.version。确保在失败的import语句之前执行这个命令：

import sys
print sys.version
from Bio import PDB

总之，关于如何更改使用的Python版本的问题，已经在这里回答过了：Linux上有两个版本的Python，如何将2.7设置为默认版本。

Answer 2

我找到了答案。主要的问题是，py.test 默认使用的是 Python 2.6，而在执行“from Bio import PDB”时会出现错误。不过，使用 Python 2.7 执行同样的命令就不会出错。为了选择不同版本的 Python，创建了一个独立的 pytest 脚本，并运行它。

py.test --genscript=curpytest
python curpytest

这样就解决了导入 Bio 时出现的错误。