NumPy和memmap: [Errno 24] 打开文件过多
我正在处理很大的矩阵,所以我在用NumPy的memmap功能。不过,我遇到了一个错误,似乎是memmap使用的文件描述符没有被关闭。
import numpy
import tempfile
counter = 0
while True:
temp_fd, temporary_filename = tempfile.mkstemp(suffix='.memmap')
map = numpy.memmap(temporary_filename, dtype=float, mode="w+", shape=1000)
counter += 1
print counter
map.close()
os.remove(temporary_filename)
根据我的理解,当调用close()方法时,memmap文件就会被关闭。但是,上面的代码不能无限循环,因为最终会抛出一个"[Errno 24] 打开的文件太多"的错误:
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1019
Traceback (most recent call last):
File "./memmap_loop.py", line 11, in <module>
File "/usr/lib/python2.5/site-packages/numpy/core/memmap.py", line 226, in __new__
EnvironmentError: [Errno 24] Too many open files
Error in sys.excepthook:
Traceback (most recent call last):
File "/usr/lib/python2.5/site-packages/apport_python_hook.py", line 38, in apport_excepthook
ImportError: No module named packaging_impl
Original exception was:
Traceback (most recent call last):
File "./memmap_loop.py", line 11, in <module>
File "/usr/lib/python2.5/site-packages/numpy/core/memmap.py", line 226, in __new__
EnvironmentError: [Errno 24] Too many open files
有没有人知道我忽略了什么?
1 个回答
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因为memmap不直接使用打开的文件描述符,而是使用文件名,所以我想你可能会泄露temp_fd
这个文件描述符。调用os.close(temp_fd)
会有帮助吗?
太好了,能正常工作。
由于你可以把numpy.memmap和一个类似文件的对象一起使用,你可以从你已经拥有的文件描述符temp_fd
创建一个这样的对象。
fobj = os.fdopen(temp_fd, "w+")
numpy.memmap(fobj, ...