导入 rpy2.robjects 报错

Question

我有一份包含一千万条记录的数据。我有一段R代码，需要通过3000次迭代来估算一个模型的系数。在这份数据上运行R代码非常耗时，有时候我的系统还会卡住。我使用的是64位的Windows 8.1，内存是4GB。

为了减少时间，我想把R和Python结合起来。虽然我对R有一定了解，但我对Python完全是新手。我发现可以用rpy2在Python中调用R（我使用的是Python 3.4.1）。

我做了以下操作：

import rpy2

import rpy2.robjects as robjects

但是出现了以下错误：

追踪记录（最近的调用在最前面）： 文件 "C:\Python34\lib\site-packages\rpy2\rinterface__init__.py"，第29行，在 0, win32con.KEY_QUERY_VALUE ) pywintypes.error: (2, 'RegOpenKeyEx', '系统找不到指定的文件。')

在处理上述异常时，又发生了另一个异常：

追踪记录（最近的调用在最前面）： 文件 ""，第1行，在 import rpy2.robjects as robjects 文件 "C:\Python34\lib\site-packages\rpy2\robjects__init__.py"，第15行，在 import rpy2.rinterface as rinterface 文件 "C:\Python34\lib\site-packages\rpy2\rinterface__init__.py"，第32行，在 except ImportError(ie): NameError: name 'ie' is not defined

我不明白为什么会出现这个错误。该如何解决这个问题呢？

不过，如果我这样做，就可以正常工作：

from rpy2 import *

如果有人能详细解释一下如何从Python调用R，并给出我问题的解决方案，那将非常有帮助。关于如何在R中更快地处理大数据的其他解决方案也会受到欢迎。

提前谢谢大家！

Answer 1

我在使用Win7 64位系统，搭配Python 2.7和R3.1.1时，遇到了完全一样的问题。

1) 首先，安装pywin32：http://sourceforge.net/projects/pywin32/
2) 然后，添加一个环境变量R_HOME：这个变量的值是R的安装路径，不是/Rx.x/bin。

虽然在导入时我还是遇到了“无法删除临时文件”的问题，但我已经能够完成这里提到的一些示例：http://rpy.sourceforge.net/rpy2/doc-dev/html/introduction.html

Answer 2

我遇到了类似的问题，因为我的环境没有正确设置，导致 import win32api 时出现了 ImportError: DLL load failed: The specified module could not be found 的错误。我通过把包含 python.exe 的文件夹添加到我的 PATH 变量中解决了这个问题。

需要注意的是，异常 NameError: name 'ie' is not defined 是 rpy2 的一个bug，它隐藏了实际的异常，这个异常是因为无法导入 win32api 或 win32con 导致的。

不过，之后我又遇到了另一个异常 (RuntimeError: R_HOME not defined)，所以我最终按照另一个答案的建议，添加了一个 R_HOME 变量（= C:\Program Files\R\R-3.1.2）。我还收到了 Unable to unlink tempfile 的警告，我猜这个问题还没有解决，具体可以参考 rpy2 windows Unable to unlink tempfile 和 https://bitbucket.org/lgautier/rpy2/issue/132/rpy2-windows-unable-to-unlink-tempfile。