使用pandas在滚动窗口中重新采样
假设我有一些每天的数据(不是规律间隔的),我想计算每个月过去5个月的移动标准差(或者其他任意的非线性函数)。比如说,对于2012年5月,我会计算从2012年1月到2012年5月这5个月的数据的标准差。对于2012年6月,计算的时间段从2012年2月开始,依此类推。最终的结果是一个包含每个月值的时间序列。
我不能使用滚动窗口,因为这首先是按天计算的,其次我需要指定值的数量(滚动窗口并不是按时间段聚合的,有些帖子讨论了这个问题,但对我来说并不相关,因为滚动计算仍然是针对每一天的)。
我不能进行重采样,因为那样的话样本会是每5个月一次,比如我只会得到2012年5月、2012年10月、2013年3月的数据……最后,由于这个函数是非线性的,我不能先进行按月采样再在其上应用5期的滚动窗口。
所以我需要一种将重采样功能应用于按时间间隔定义的滚动窗口(而不是按值的数量)的方式。
我该如何在pandas中实现这个呢?一种方法可能是将几个(在这个例子中是5个)重采样的(5个月)时间序列结合起来,每个序列有一个月的偏移,然后将这些序列对齐成一个……但我不知道该如何实现这个。
3 个回答
这是一个尝试,虽然不是特别干净,但可能有效。
这里有一些示例数据:
df = pd.DataFrame(data={'a': 1.},
index=pd.date_range(start='2001-1-1', periods=1000))
首先,定义一个函数,用来减少日期的月份,n
表示减少的月份数。这个函数需要进一步整理,但对于n
小于等于12的情况是可以工作的。
from datetime import datetime
def decrease_month(date, n):
assert(n <= 12)
new_month = date.month - n
year_offset = 0
if new_month <= 0:
year_offset = -1
new_month = 12 + new_month
return datetime(date.year + year_offset, new_month, 1)
接着,为每个日期添加5个新列,代表它会跨越的5个滚动周期。
for n in range(rolling_period):
df['m_' + str(n)] = df.index.map(lambda x: decrease_month(x, n))
然后,使用melt
函数把数据从宽格式转换为长格式,这样每个滚动周期就会有一个条目。
df_m = pd.melt(df, id_vars='a')
你应该能够根据新创建的列进行分组,这样每个日期就能代表正确的5个月滚动周期。
In [222]: df_m.groupby('value').sum()
Out[222]:
a
value
2000-09-01 31
2000-10-01 59
2000-11-01 90
2000-12-01 120
2001-01-01 151
2001-02-01 150
2001-03-01 153
2001-04-01 153
2001-05-01 153
2001-06-01 153
2001-07-01 153
...
我用下面的代码解决了一个类似的问题:
interval = 5
frames = []
for base in range(interval):
frame = data.resample(f"{interval}min", base=base).last()
frames.append(frame)
pd.concat(frames, axis=0).sort_index()
在这里,我创建了5个数据框,它们在相同的时间间隔内重新采样,但有不同的偏移量(也就是基准参数)。然后我只需要把它们合并在一起并排序。这样做通常比滚动加重新采样要高效得多(唯一的额外开销就是排序)。
我遇到过类似的问题,涉及到一个时间差序列,我想计算移动平均值,然后重新采样。这里有一个例子,我有100秒的数据。我对每10秒的数据计算一个滚动平均值,然后每5秒重新采样一次,从每个重新采样的区间中取第一个数据。最终的结果应该是在5秒的间隔中显示之前10秒的平均值。如果你想的话,也可以用月份格式来做类似的事情,而不是用秒:
df = pd.DataFrame(range(0,100), index=pd.TimedeltaIndex(range(0,100),'s'))
df.rolling('10s').mean().resample('5s').first()
结果:
0
00:00:00 0.0
00:00:05 2.5
00:00:10 5.5
00:00:15 10.5
00:00:20 15.5
00:00:25 20.5
00:00:30 25.5
00:00:35 30.5
00:00:40 35.5
00:00:45 40.5
00:00:50 45.5
00:00:55 50.5
00:01:00 55.5
00:01:05 60.5
00:01:10 65.5
00:01:15 70.5
00:01:20 75.5
00:01:25 80.5
00:01:30 85.5
00:01:35 90.5