导入pandas.rpy.common时在Python中出现段错误11

Question

我正在使用Mountain Lion系统，默认安装了Python 2.7.2。我用这个版本的Python设置了一个新的虚拟环境，并通过pip install安装了一些包，比如numpy、matplotlib、ipython等。我还在开发一个脚本，用来从R中加载数据，所以我也安装了rpy2。当我在终端启动Python时，可以正常导入所有已安装的包（例如numpy、matplotlib等），没有任何问题。但是，当我输入以下命令：

import pandas.rpy.common as com

或者

import rpy2.robjects as objects

然后在Python中输入exit()退出时，系统报告了一个分段错误11。如果我在Python提示符下单独输入每个命令，这个问题可能不算太严重，因为这些命令似乎都能正常工作。然而，我无法将这些命令作为一个较长脚本的一部分运行，因为这个错误似乎会导致脚本提前停止。

我安装的pandas版本是0.14.1（之前是0.14.0，问题一样）。R的版本是3.1.1。我尝试重新安装R，并创建新的虚拟环境，重新安装所有包。

关于分段错误11，有很多讨论，认为这是由于Mavericks引入的变化造成的。但我认为这些问题不应该影响Mountain Lion。任何建议都将不胜感激。

Answer 1

在一些安装了系统版R（比如说RStudio）的机器上，如果同时在一个环境中安装了rpy2（比如用conda），那么系统版的R会被使用。但是，这个系统版的R可能和rpy2构建时用的版本不兼容，这样就会导致程序崩溃（也就是出现“段错误”）。

要检查你使用的R版本是否和rpy2捆绑的版本不同，可以运行以下命令：

import rpy2
for row in rpy2.situation.iter_info():
    print(row)

想了解更多信息，可以查看这个回答。